HOXC4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

HOXC4是HOX基因家族成员,参与胚胎发育和造血调控,与白血病等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 HOXC4
基因全名 homeobox C4
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.13
NCBI Gene ID 3221 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3221
Ensembl ID ENSG00000180818
UniProt ID P09017
OMIM ID 142974
HGNC ID 5018
基因别名 HOX3E

基因功能与研究简介

HOXC4基因属于HOX基因家族,编码含有同源异型盒的转录因子,在胚胎发育中调控前后轴模式形成。在成体中,HOXC4在造血系统中表达,参与B细胞和T细胞的分化调控。研究表明HOXC4异常表达与某些白血病和实体瘤相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性淋巴细胞白血病 HOXC4异常表达可能影响造血分化,但具体机制尚不明确 暂无明确证据
急性髓系白血病 HOXC4在AML中表达异常,可能参与白血病发生 暂无明确证据
结直肠癌 HOXC4表达上调与肿瘤进展相关,但机制未明 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性髓系白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 早幼粒细胞白血病细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但证据不足
c.456C>T (p.S152F) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但证据不足
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致HOXC4蛋白活性降低或丧失,影响正常发育和造血调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强HOXC4的转录活性,促进异常细胞增殖。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰野生型HOXC4的功能,导致调控异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0007275 (multicellular organism development)

相关通路

hsa04340 (Hedgehog signaling pathway)
hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)

蛋白质功能简介

HOXC4蛋白属于同源异型盒转录因子家族,包含一个保守的homeodomain,能够结合DNA并调控下游基因表达。在胚胎发育中,HOXC4参与前后轴模式形成;在成体中,其在造血细胞中表达,调节B细胞和T细胞的分化。HOXC4的异常表达与白血病和实体瘤相关,但具体机制仍在研究中。

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