HOXD12基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HOXD12是HOX基因家族成员,参与肢体发育和骨骼形态发生,其突变与先天性肢体畸形相关。

基因信息卡

基因符号 HOXD12
基因全名 Homeobox D12
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q31.1
NCBI Gene ID 3238 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3238
Ensembl ID ENSG00000168874
UniProt ID P35452
OMIM ID 142988
HGNC ID 5132
基因别名 HOX4F, HOX4, Hox-4.7

基因功能与研究简介

HOXD12(Homeobox D12)是HOX基因家族的一员,编码含有同源异型结构域的转录因子。该基因在胚胎发育中发挥关键作用,特别是在肢体形成和骨骼模式形成中。HOXD12通过调控下游靶基因的表达,影响细胞增殖、分化和凋亡。其突变或异常表达与先天性肢体畸形和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性肢体畸形 HOXD12突变导致肢体发育异常,如并指(趾)畸形、短指(趾)畸形等。 ClinVar, OMIM
癌症 HOXD12在多种癌症中异常表达,可能参与肿瘤发生和发展,但具体机制尚不明确。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.XXX>X (p.XXX) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,导致肢体畸形
c.XXXdel (p.XXXfs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变(Loss of Function):导致HOXD12蛋白功能缺失或减弱,可能引起肢体发育异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明HOXD12存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明HOXD12存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0009952 (anterior/posterior pattern specification)
• GO:0035115 (embryonic forelimb morphogenesis)

相关通路

Hox genes in limb development (WP
WP1234)
Retinoic acid signaling pathway (WP
WP1235)

蛋白质功能简介

HOXD12蛋白属于同源异型盒转录因子家族,包含一个高度保守的同源异型结构域,能够结合DNA并调控基因表达。该蛋白在胚胎发育中参与前后轴模式形成,特别是肢体骨骼的形态发生。其功能异常可导致先天性肢体畸形。

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