HPCAL4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

HPCAL4编码一种钙结合蛋白,参与神经元信号传导,其表达异常可能与神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 HPCAL4
基因全名 hippocalcin like 4
基因类型 protein coding
染色体位置 1p34.2
NCBI Gene ID 51440 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51440
Ensembl ID ENSG00000143321
UniProt ID Q9UM19
OMIM ID 607785
HGNC ID 17936
基因别名 HLP4

基因功能与研究简介

HPCAL4(hippocalcin like 4)基因编码一种属于神经元钙传感器家族的钙结合蛋白。该蛋白包含EF-hand结构域,能够结合钙离子,参与神经元内钙信号传导的调控。HPCAL4在脑组织中高表达,尤其在海马和皮层区域,可能参与突触可塑性、神经元兴奋性调节等过程。研究表明,HPCAL4的表达异常可能与神经系统疾病(如精神分裂症、阿尔茨海默病)相关,但具体机制尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 HPCAL4表达水平在精神分裂症患者前额叶皮层中显著降低,可能影响钙信号传导和突触功能,参与疾病病理过程。 较强研究证据
阿尔茨海默病 HPCAL4在阿尔茨海默病患者脑组织中表达异常,可能参与神经元钙稳态失调和神经退行性变。 潜在关联
双相情感障碍 HPCAL4基因多态性与双相情感障碍的关联研究提示其可能作为易感基因,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3747129 SNV 0.15 位于3'UTR,可能影响miRNA结合,导致表达水平改变
rs11558397 SNV 0.08 错义突变,导致氨基酸替换,可能影响蛋白稳定性或功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005509 calcium ion binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005886 plasma membrane • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0007268 chemical synaptic transmission

相关通路

Calcium signaling pathway (WP106)
Synaptic vesicle cycle (WP2267)

蛋白质功能简介

HPCAL4蛋白属于神经元钙传感器家族,包含4个EF-hand结构域,其中两个具有钙结合能力。该蛋白在脑组织中高表达,定位于细胞质和质膜,参与钙离子介导的信号转导。HPCAL4可能通过调节钙离子浓度影响神经元兴奋性和突触传递。其表达异常与神经系统疾病相关,但具体分子机制尚待阐明。

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