HPGD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HPGD基因编码15-羟基前列腺素脱氢酶,是前列腺素降解的关键酶,其功能缺失与多种遗传性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 HPGD
基因全名 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q34.1
NCBI Gene ID 3248 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3248
Ensembl ID ENSG00000147065
UniProt ID P15428
OMIM ID 601688
HGNC ID 5154
基因别名 PGDH, PGDH1, 15-PGDH, SDR36C1

基因功能与研究简介

HPGD基因编码15-羟基前列腺素脱氢酶(15-PGDH),该酶是前列腺素降解的关键酶,催化15(S)-羟基前列腺素的氧化,从而灭活前列腺素。该酶在多种组织中表达,尤其在肺、胎盘和肾脏中高表达。HPGD基因突变可导致原发性肥厚性骨关节病(PHO),并可能影响多种癌症的发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
原发性肥厚性骨关节病 HPGD基因功能缺失突变导致前列腺素降解障碍,引起前列腺素E2水平升高,导致骨膜新骨形成和杵状指等症状。 已明确致病
结直肠癌 HPGD表达下调或缺失与结直肠癌的发生和进展相关,可能通过影响前列腺素代谢促进肿瘤生长。 具有较强研究证据
肺癌 HPGD表达降低与肺癌预后不良相关,可能通过调节前列腺素水平影响肿瘤微环境。 具有较强研究证据
胃癌 HPGD表达下调与胃癌的侵袭和转移相关,可能通过影响前列腺素代谢促进肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
胎盘 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
小肠 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.310C>T (p.Arg104Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.563G>A (p.Trp188Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.682C>T (p.Arg228Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.799G>A (p.Gly267Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

HPGD基因的失功能突变导致15-PGDH酶活性丧失或降低,使前列腺素降解受阻,引起前列腺素水平升高,与原发性肥厚性骨关节病等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明HPGD存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明HPGD突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004307: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (NAD+) activity • GO:0001516: prostaglandin biosynthetic process
• GO:0006693: prostaglandin metabolic process • GO:0005737: cytoplasm
• GO:0005829: cytosol

相关通路

Prostaglandin synthesis and metabolism (Reactome: R-HSA-2142691)
Arachidonic acid metabolism (KEGG: hsa00590)

蛋白质功能简介

15-羟基前列腺素脱氢酶(15-PGDH)属于短链脱氢酶/还原酶家族,以NAD+为辅因子,催化前列腺素E2、F2α等15(S)-羟基氧化为15-酮基衍生物,从而使其失活。该酶在调节前列腺素局部浓度中起关键作用,影响炎症、细胞增殖和分化。HPGD基因突变导致酶活性丧失,引起前列腺素蓄积,导致原发性肥厚性骨关节病。在多种癌症中,HPGD表达下调与肿瘤进展和不良预后相关。

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