ICE1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ICE1是转录调控和RNA加工的关键因子,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ICE1 |
|---|---|
| 基因全名 | interactor of little elongation complex ELL subunit 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5p15.2 |
| NCBI Gene ID | 23389 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23389 |
| Ensembl ID | ENSG00000164332 |
| UniProt ID | Q9Y6Y0 |
| OMIM ID | 617442 |
| HGNC ID | 28985 |
| 基因别名 | KIAA0947, FLJ10154 |
基因功能与研究简介
ICE1(interactor of little elongation complex ELL subunit 1)是Little Elongation Complex(LEC)的组成部分,该复合物参与RNA聚合酶II的转录延伸,并调控小核RNA(snRNA)和端粒酶RNA的转录。ICE1在神经发育中发挥重要作用,其突变与神经发育障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | ICE1基因突变导致功能丧失,影响snRNA转录,进而干扰神经发育。 | ClinVar, OMIM |
| 智力障碍 | ICE1突变与常染色体隐性遗传的智力障碍相关。 | OMIM, ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.567_568del (p.Glu190fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致ICE1蛋白截短或降解,影响LEC复合物功能,导致snRNA转录异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006369 termination of RNA polymerase II transcription | • GO:0042795 snRNA transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• Little Elongation Complex (LEC) pathway
蛋白质功能简介
ICE1蛋白是Little Elongation Complex(LEC)的亚基,该复合物包含ICE1、ICE2和ELL,参与RNA聚合酶II的转录延伸,并特异性调控snRNA和端粒酶RNA的转录。ICE1通过其N端区域与ELL相互作用,C端区域可能参与RNA结合。ICE1的突变导致LEC功能异常,进而影响snRNA的合成,最终导致神经发育障碍。
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