ID4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ID4基因编码DNA结合抑制剂4,参与细胞分化与发育调控,与多种癌症及神经发育疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ID4 |
|---|---|
| 基因全名 | Inhibitor of DNA binding 4, dominant negative helix-loop-helix protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p22.3 |
| NCBI Gene ID | 3400 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3400 |
| Ensembl ID | ENSG00000128908 |
| UniProt ID | P47928 |
| OMIM ID | 600581 |
| HGNC ID | 5363 |
| 基因别名 | ['IDB4', 'bHLHb27'] |
基因功能与研究简介
ID4基因编码DNA结合抑制剂4(Inhibitor of DNA binding 4),属于ID蛋白家族,该家族蛋白含有螺旋-环-螺旋(HLH)结构域,但缺乏DNA结合域,因此作为显性负性调节因子抑制碱性HLH转录因子的活性。ID4在多种组织中表达,尤其在发育过程中参与细胞分化、细胞周期调控和凋亡。研究表明,ID4在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因,具体作用取决于组织类型和肿瘤阶段。此外,ID4还参与神经发育和免疫调节。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | ID4在乳腺癌中表达下调,可能通过抑制肿瘤细胞增殖和侵袭发挥抑癌作用。 | 较强研究证据 |
| 前列腺癌 | ID4在前列腺癌中表达下调,与肿瘤进展和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | ID4在胃癌中表达下调,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 神经发育障碍 | ID4在神经发育中起重要作用,其异常表达可能与智力障碍等相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PC3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
| AGS | 暂无可靠数据 | 胃癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | SNV | 罕见 | 可能影响翻译起始,导致功能丧失 |
| c.250C>T (p.Arg84Ter) | SNV | 罕见 | 引入提前终止密码子,导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致ID4蛋白功能缺失,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明ID4存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
ID4本身作为显性负性调节因子,其突变可能影响其抑制功能,但具体机制尚不明确。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0046983 (protein dimerization activity) | • GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• hsa05200 (Pathways in cancer)
• hsa05215 (Prostate cancer)
• hsa05224 (Breast cancer)
蛋白质功能简介
ID4蛋白属于ID蛋白家族,含有HLH结构域但缺乏DNA结合域,通过形成异源二聚体抑制碱性HLH转录因子的DNA结合和转录活性。ID4在细胞分化、细胞周期调控和凋亡中发挥重要作用。在多种癌症中,ID4表达下调,可能通过解除对细胞增殖的抑制而促进肿瘤发生。此外,ID4还参与神经发育和免疫调节。
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