IDH2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
IDH2基因编码异柠檬酸脱氢酶2,其突变在多种肿瘤中发挥关键作用,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | IDH2 |
|---|---|
| 基因全名 | Isocitrate Dehydrogenase (NADP(+)) 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q26.1 |
| NCBI Gene ID | 3418 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3418 |
| Ensembl ID | ENSG00000182054 |
| UniProt ID | P48735 |
| OMIM ID | 147650 |
| HGNC ID | 5383 |
| 基因别名 | IDHM; IDH; mNADP-IDH; isocitrate dehydrogenase 2 (NADP+), mitochondrial |
基因功能与研究简介
IDH2基因编码线粒体NADP依赖性异柠檬酸脱氢酶,催化异柠檬酸氧化脱羧生成α-酮戊二酸(α-KG),同时将NADP+还原为NADPH。该酶在细胞代谢、氧化还原平衡和表观遗传调控中发挥重要作用。IDH2突变(尤其是R140和R172位点)可导致酶功能获得性改变,产生致癌代谢物2-羟基戊二酸(2-HG),抑制α-KG依赖性双加氧酶,从而影响DNA和组蛋白甲基化,促进肿瘤发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性髓系白血病(AML) | IDH2突变(R140Q、R172K等)导致2-HG积累,抑制TET2等α-KG依赖性酶,引起DNA高甲基化和细胞分化阻滞,促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 胶质瘤 | IDH2突变(R172位点)在低级别胶质瘤和继发性胶质母细胞瘤中常见,导致2-HG产生,影响细胞分化,与预后相关。 | 已明确致病 |
| 软骨肉瘤 | IDH2突变(R172S等)在软骨肉瘤中频繁出现,通过2-HG影响表观遗传,促进肿瘤进展。 | 已明确致病 |
| 胆管癌 | IDH2突变(R172位点)在肝内胆管癌中发生,与肿瘤发生和不良预后相关。 | 已明确致病 |
| D-2-羟基戊二酸尿症 | IDH2功能缺失突变导致α-KG生成减少,影响代谢,但该病罕见,与肿瘤突变不同。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| R140Q | 点突变 | AML中约10-15% | 功能获得性突变,产生2-HG,抑制α-KG依赖性酶 |
| R172K | 点突变 | 胶质瘤、AML中常见 | 功能获得性突变,产生2-HG,影响表观遗传 |
| R172S | 点突变 | 软骨肉瘤中常见 | 功能获得性突变,产生2-HG |
| R172G | 点突变 | 胆管癌中报道 | 功能获得性突变,产生2-HG |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
IDH2功能缺失突变(如某些遗传性代谢病)导致α-KG生成减少,影响线粒体代谢,但较少见。
Gain of Function(功能获得,GOF)
IDH2热点突变(R140、R172)获得新功能,将α-KG转化为2-HG,致癌。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明IDH2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004450 isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity | • GO:0005739 mitochondrion |
| • GO:0006102 isocitrate metabolic process | • GO:0006739 NADP metabolic process |
| • GO:0055114 oxidation-reduction process |
相关通路
• Citrate cycle (TCA cycle) - Homo sapiens (human) (hsa00020)
• 2-Oxocarboxylic acid metabolism (hsa01210)
• Metabolic pathways (hsa01100)
蛋白质功能简介
IDH2蛋白是线粒体基质中的NADP依赖性异柠檬酸脱氢酶,由452个氨基酸组成,以同源二聚体形式存在。该酶催化异柠檬酸氧化脱羧生成α-KG,同时产生NADPH,参与细胞抗氧化防御和脂质合成。IDH2突变(如R140Q、R172K)导致酶构象改变,获得将α-KG还原为2-HG的新活性,2-HG竞争性抑制α-KG依赖性双加氧酶,包括TET2和组蛋白去甲基化酶,导致DNA和组蛋白高甲基化,阻断细胞分化,促进肿瘤发生。
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