IDH3B基因|基因功能、疾病关联、突变与代谢研究

IDH3B编码线粒体异柠檬酸脱氢酶3β亚基,参与TCA循环,其突变与视网膜色素变性和代谢异常相关。

基因信息卡

基因符号 IDH3B
基因全名 isocitrate dehydrogenase (NAD(+)) 3 non-catalytic subunit beta
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p13
NCBI Gene ID 3420 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3420
Ensembl ID ENSG00000101365
UniProt ID O43837
OMIM ID 604526
HGNC ID 5384
基因别名 H-IDHB, IDH3B, RP46

基因功能与研究简介

IDH3B基因编码线粒体NAD依赖性异柠檬酸脱氢酶3复合物的非催化β亚基。该复合物催化异柠檬酸氧化脱羧为α-酮戊二酸,是TCA循环的关键限速步骤。IDH3B突变可导致酶活性降低,影响能量代谢,并与视网膜色素变性(RP46型)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性46型 IDH3B突变导致酶活性降低,影响视网膜细胞能量供应,导致感光细胞退化。 已明确致病
Leber先天性黑矇 部分IDH3B突变与严重的视网膜病变相关,但证据有限。 潜在关联
癌症 IDH3B在多种肿瘤中表达异常,可能通过代谢重编程影响肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HepG2 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.359G>A (p.Arg120His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,导致酶活性降低
c.490C>T (p.Arg164Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠,导致酶活性降低
c.724A>G (p.Thr242Ala) 错义突变 罕见 可能影响催化活性,导致酶活性降低
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

多数IDH3B突变导致酶活性降低或蛋白不稳定,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明IDH3B突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能通过显性负效应干扰复合物组装,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000287 magnesium ion binding • GO:0004449 isocitrate dehydrogenase (NAD+) activity
• GO:0005739 mitochondrion • GO:0006099 tricarboxylic acid cycle
• GO:0051287 NAD binding

相关通路

TCA cycle (KEGG: hsa00020)
Metabolic pathways (KEGG: hsa01100)

蛋白质功能简介

IDH3B蛋白是线粒体异柠檬酸脱氢酶3复合物的非催化亚基,该复合物由α、β、γ三个亚基组成。β亚基虽无催化活性,但对复合物的稳定性和活性至关重要。IDH3B蛋白包含一个保守的NAD结合域,参与底物结合和催化调节。

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