IFRD2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IFRD2(Interferon-Related Developmental Regulator 2)是一种与干扰素信号和细胞分化相关的调控因子,在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。

基因信息卡

基因符号 IFRD2
基因全名 Interferon-Related Developmental Regulator 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p21.31
NCBI Gene ID 7866 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7866
Ensembl ID ENSG00000114771
UniProt ID Q12884
OMIM ID 603902
HGNC ID HGNC:5422
基因别名 SKMc15, SMAP, SMAP1

基因功能与研究简介

IFRD2(干扰素相关发育调节因子2)是IFRD蛋白家族成员,参与细胞分化、增殖和凋亡的调控。该基因位于染色体3p21.31,该区域在多种肿瘤中频繁缺失,提示IFRD2可能作为肿瘤抑制因子。IFRD2在多种组织中表达,尤其在骨骼肌和心脏中高表达。研究表明,IFRD2参与干扰素信号通路和细胞周期调控,其表达异常与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) IFRD2表达下调或缺失可能促进肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 较强研究证据
神经发育障碍 有研究提示IFRD2可能与神经发育相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.456delA (p.Lys153SerfsTer23) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变或剪接位点突变可能导致蛋白功能丧失,与肿瘤发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation)

相关通路

Interferon signaling pathway (Reactome: R-HSA-913531)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

IFRD2蛋白含有多个磷酸化位点,可能参与信号转导。其亚细胞定位主要在细胞核和细胞质,可能参与转录调控。IFRD2与MYC相互作用,可能影响细胞增殖。

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