IFT20基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IFT20是鞭毛内运输复合体B的核心亚基,对纤毛形成和功能至关重要,其突变与纤毛病相关。

基因信息卡

基因符号 IFT20
基因全名 intraflagellar transport 20
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q21.2
NCBI Gene ID 90410 ncbi.nlm.nih.gov/gene/90410
Ensembl ID ENSG00000109084
UniProt ID Q8IY34
OMIM ID 614394
HGNC ID 26767
基因别名 FLJ12442, MGC105037

基因功能与研究简介

IFT20是鞭毛内运输(IFT)复合体B的亚基,参与纤毛的组装和维持。纤毛是细胞表面的微管结构,在信号转导和细胞运动中发挥关键作用。IFT20在纤毛基体和高尔基体之间运输,对纤毛蛋白的转运至关重要。研究表明,IFT20的突变或功能异常与纤毛病(如肾消耗病、视网膜变性等)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肾消耗病 IFT20突变导致纤毛功能障碍,影响肾小管上皮细胞纤毛信号,引起肾囊肿和肾功能进行性丧失。 ClinVar, OMIM
视网膜变性 IFT20在视网膜光感受器细胞中高表达,其突变导致纤毛运输异常,引起光感受器退化。 ClinVar, OMIM
肝纤维化 IFT20突变可能影响胆管细胞纤毛功能,导致肝纤维化。 ClinVar, OMIM

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
视网膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
hTERT-RPE1 暂无可靠数据 常用于纤毛研究
IMCD3 暂无可靠数据 肾集合管细胞系,用于纤毛研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.179G>A (p.Arg60His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或功能,导致纤毛组装缺陷
c.340C>T (p.Arg114*) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失,引起纤毛病
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

IFT20突变导致蛋白功能丧失,影响纤毛组装和信号转导,是纤毛病的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明IFT20存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明IFT20突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005813 (centrosome) • GO:0005814 (centriole)
• GO:0005815 (microtubule organizing center) • GO:0005856 (cytoskeleton)
• GO:0005929 (cilium) • GO:0005930 (axoneme)
• GO:0005938 (cell cortex) • GO:0016020 (membrane)
• GO:0030992 (intraflagellar transport particle B) • GO:0035253 (ciliary basal body)
• GO:0042995 (cell projection) • GO:0060271 (cilium assembly)
• GO:1903441 (protein localization to ciliary membrane)

相关通路

Intraflagellar transport (IFT) (GO:0035735)
Cilium assembly (GO:0060271)
Hedgehog signaling pathway (GO:0007224)

蛋白质功能简介

IFT20蛋白是鞭毛内运输复合体B的亚基,分子量约20 kDa。它包含一个N端的coiled-coil结构域,参与蛋白相互作用。IFT20定位于纤毛基体和高尔基体,负责将纤毛蛋白从高尔基体运输到纤毛基体,并参与纤毛的组装和维持。在细胞中,IFT20对纤毛的形成和功能至关重要,其缺失会导致纤毛缺陷。

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