IFT38基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IFT38是编码IFT-B复合物亚基的基因,参与纤毛内运输,其突变与纤毛相关疾病有关。

基因信息卡

基因符号 IFT38
基因全名 intraflagellar transport 38
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q23.1
NCBI Gene ID 51077 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51077
Ensembl ID ENSG00000135446
UniProt ID Q96FG2
OMIM ID 614184
HGNC ID 26067
基因别名 CFAP91, DYDC1, MKS7

基因功能与研究简介

IFT38(intraflagellar transport 38)编码IFT-B复合物的一个亚基,该复合物参与纤毛内运输(IFT),对纤毛的组装和功能至关重要。IFT38突变与多种纤毛相关疾病有关,包括Meckel综合征和Bardet-Biedl综合征。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Meckel综合征 IFT38突变导致纤毛功能障碍,影响胚胎发育,表现为多囊肾、脑膨出和多指畸形。 已明确致病
Bardet-Biedl综合征 IFT38突变与BBS相关,导致视网膜色素变性、肥胖、多指畸形和肾功能异常。 已明确致病
纤毛相关疾病 IFT38突变可能与其他纤毛疾病相关,如Joubert综合征,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
气管 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
hTERT-RPE1 暂无可靠数据 纤毛研究常用细胞系
IMCD3 暂无可靠数据 肾集合管细胞系,常用于纤毛研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能引起纤毛功能障碍
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体机制尚不明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致IFT38蛋白功能丧失或减弱,影响纤毛组装和功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明IFT38突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明IFT38突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005813 (centrosome) • GO:0005929 (cilium)
• GO:0030992 (intraflagellar transport particle B) • GO:0035729 (intraflagellar transport)

相关通路

hsa04520 (Adherens junction)
hsa04530 (Tight junction)
hsa04540 (Gap junction)
hsa04550 (Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells)
hsa04560 (Axon guidance)
hsa04570 (VEGF signaling pathway)
hsa04580 (Wnt signaling pathway)
hsa04590 (Hedgehog signaling pathway)

蛋白质功能简介

IFT38蛋白是IFT-B复合物的一个亚基,该复合物参与纤毛内运输(IFT),对纤毛的组装和功能至关重要。IFT38蛋白定位于纤毛和中心体,参与调控纤毛内蛋白质的运输。IFT38突变可导致纤毛功能障碍,进而引发多种纤毛相关疾病。

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