IFT52基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IFT52编码鞭毛内运输蛋白52,是纤毛组装和功能的关键因子,其突变与多种纤毛病相关。

基因信息卡

基因符号 IFT52
基因全名 intraflagellar transport 52
基因类型 protein-coding
染色体位置 20q13.3
NCBI Gene ID 51098 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51098
Ensembl ID ENSG00000101210
UniProt ID Q9Y366
OMIM ID 617094
HGNC ID 15901
基因别名 DYF-52, IFT52, MGC126851, MGC126853

基因功能与研究简介

IFT52基因编码鞭毛内运输蛋白52(IFT52),是IFT复合体B的组成部分,参与纤毛内蛋白质的运输和纤毛的组装。IFT52在细胞分裂、信号转导和感觉功能中发挥重要作用。IFT52突变可导致多种纤毛病,如骨骼发育异常和视网膜变性。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
短肋胸廓发育不良11型 IFT52突变导致纤毛功能异常,影响骨骼发育,已明确致病。 ClinVar, OMIM
视网膜色素变性 IFT52突变影响感光细胞纤毛功能,导致视网膜变性,具有较强研究证据。 ClinVar, OMIM
多囊肾 IFT52突变可能影响肾小管纤毛功能,与多囊肾相关,潜在关联。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
气管 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
RPE1 暂无可靠数据 纤毛研究常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1186C>T (p.Arg396Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失
c.1042G>A (p.Gly348Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质结构,功能受损
c.1330A>G (p.Thr444Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):突变导致IFT52蛋白功能部分或完全丧失,影响纤毛组装和功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明IFT52突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负效):目前暂无明确证据表明IFT52突变具有显性负效效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005813 centrosome • GO:0005814 centriole
• GO:0005856 cytoskeleton • GO:0005929 cilium
• GO:0030992 intraflagellar transport particle B • GO:0035253 ciliary basal body
• GO:0042995 cell projection • GO:0060271 cilium assembly

相关通路

Pathway: Intraflagellar transport (IFT) (WP
WP000000)
Pathway: Ciliary assembly (Reactome: R-HSA-5620920)

蛋白质功能简介

IFT52蛋白是鞭毛内运输复合体B的亚基,分子量约52 kDa。该蛋白包含多个WD40重复结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用,对于IFT复合体的稳定性和纤毛内运输至关重要。IFT52在纤毛形成和维持中发挥关键作用,其功能障碍可导致纤毛病。

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