IGDCC3基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
IGDCC3(免疫球蛋白超家族DCC亚类成员3)是一种在细胞黏附与信号转导中可能发挥作用的蛋白,其表达异常与多种肿瘤相关,但具体功能与致病机制仍在研究中。
基因信息卡
| 基因符号 | IGDCC3 |
|---|---|
| 基因全名 | Immunoglobulin Superfamily DCC Subclass Member 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q22.31 |
| NCBI Gene ID | 9543 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9543 |
| Ensembl ID | ENSG00000137801 |
| UniProt ID | Q8IX30 |
| OMIM ID | 610194 |
| HGNC ID | 21279 |
| 基因别名 | PUNC |
基因功能与研究简介
IGDCC3(免疫球蛋白超家族DCC亚类成员3)编码一种I型跨膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族,包含多个免疫球蛋白样结构域和纤维连接蛋白III型结构域。该蛋白可能参与细胞黏附、细胞迁移和信号转导过程。研究表明,IGDCC3在多种肿瘤中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因发挥作用,但其具体功能与机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | IGDCC3在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附与迁移参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | IGDCC3在肝细胞癌中表达降低,与患者预后不良相关,可能作为潜在抑癌基因。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | IGDCC3在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤侵袭与转移。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | IGDCC3在非小细胞肺癌中表达下调,可能影响肿瘤细胞增殖与凋亡。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.567_568insA (p.Gly190fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.890A>G (p.Gln297Arg) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白截短或降解,可能使IGDCC3失去抑癌功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明IGDCC3存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明IGDCC3存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
IGDCC3蛋白是一种跨膜蛋白,包含多个免疫球蛋白样结构域,可能参与细胞间相互作用和信号转导。其表达在多种肿瘤中下调,提示可能作为肿瘤抑制因子。然而,其具体分子机制和信号通路尚不明确,需要进一步研究。