ILF3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ILF3编码双链RNA结合蛋白,参与基因调控、免疫应答和应激反应,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 ILF3
基因全名 Interleukin Enhancer Binding Factor 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.2
NCBI Gene ID 3609 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3609
Ensembl ID ENSG00000129351
UniProt ID Q12906
OMIM ID 603182
HGNC ID 6038
基因别名 DRBF; MMPH; MPHOSPH9; NF90; NFAR-1; NFAR2; TCP80

基因功能与研究简介

ILF3基因编码一种双链RNA结合蛋白,属于NFAR家族。该蛋白参与多种细胞过程,包括基因表达调控、mRNA稳定、DNA损伤应答、免疫应答和应激颗粒形成。ILF3在细胞核和细胞质中均有分布,通过与RNA和蛋白质相互作用发挥功能。研究表明,ILF3在病毒感染、炎症反应和肿瘤发生中扮演重要角色。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 ILF3在肝细胞癌中高表达,可能通过调控细胞增殖和凋亡相关基因促进肿瘤进展。 较强研究证据
乳腺癌 ILF3在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过影响mRNA稳定性促进肿瘤侵袭。 较强研究证据
病毒感染 ILF3参与宿主对病毒感染的免疫应答,与病毒RNA结合并调节干扰素反应。 较强研究证据
自身免疫性疾病 ILF3可能参与自身免疫性疾病的发病机制,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567C>T (p.Pro189Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.890_891insA (p.Arg297fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致ILF3蛋白表达减少或功能缺失,影响RNA结合和基因调控,可能与疾病发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强ILF3的RNA结合能力或改变其相互作用,导致异常基因表达,但具体证据尚不充分。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能产生干扰正常ILF3功能的蛋白,但目前在ILF3中尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003725 - double-stranded RNA binding • GO:0005634 - nucleus
• GO:0005737 - cytoplasm • GO:0003676 - nucleic acid binding
• GO:0005515 - protein binding • GO:0044822 - poly(A) RNA binding

相关通路

hsa04622: RIG-I-like receptor signaling pathway
hsa05164: Influenza A
hsa05168: Herpes simplex virus 1 infection

蛋白质功能简介

ILF3蛋白是一种双链RNA结合蛋白,包含双链RNA结合域和RGG盒,参与RNA代谢和基因调控。它与其他蛋白如ILF2形成复合物,调节mRNA的稳定性、翻译和核输出。ILF3在应激条件下可形成应激颗粒,参与细胞保护。此外,ILF3还参与DNA损伤应答和细胞周期调控。

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