INO80D基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
INO80D是染色质重塑复合物INO80的亚基,参与DNA修复和转录调控,与多种癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | INO80D |
|---|---|
| 基因全名 | INO80 complex subunit D |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q33.3 |
| NCBI Gene ID | 54891 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54891 |
| Ensembl ID | ENSG00000115286 |
| UniProt ID | Q9H1P3 |
| OMIM ID | 610169 |
| HGNC ID | 26056 |
| 基因别名 | INO80 complex subunit D; FLJ20309; MGC126851 |
基因功能与研究简介
INO80D(INO80 complex subunit D)是INO80染色质重塑复合物的一个亚基,该复合物在DNA双链断裂修复、转录调控和染色质重塑中发挥关键作用。INO80D蛋白包含一个HSA结构域,可能参与ATP酶活性的调节。研究表明,INO80D在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤的发生和发展。此外,INO80D还参与胚胎发育和干细胞维持。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | INO80D在多种癌症中表达上调或下调,可能通过影响DNA修复和基因表达调控促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | INO80D在胚胎发育中表达,可能参与器官形成,但具体致病性尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响INO80复合物的功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006338 (chromatin remodeling) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• hsa03440 (Homologous recombination)
• hsa03430 (Mismatch repair)
蛋白质功能简介
INO80D蛋白是INO80染色质重塑复合物的亚基,该复合物参与DNA双链断裂修复、转录调控和染色质重塑。INO80D包含HSA结构域,可能参与ATP酶活性调节。在细胞核中,INO80D与INO80复合物其他亚基相互作用,共同执行功能。研究表明,INO80D在多种癌症中表达异常,可能通过影响DNA修复和基因表达调控促进肿瘤发生。