IRF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IRF1是干扰素调节因子家族的关键成员,调控免疫应答、细胞凋亡和肿瘤抑制,在多种疾病中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 IRF1
基因全名 Interferon Regulatory Factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.1
NCBI Gene ID 3659 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3659
Ensembl ID ENSG00000125347
UniProt ID P10914
OMIM ID 147575
HGNC ID 6116
基因别名 IRF-1, MAR

基因功能与研究简介

IRF1(干扰素调节因子1)是干扰素调节因子家族的重要成员,作为转录因子调控多种基因的表达,参与免疫应答、细胞凋亡、细胞周期调控和肿瘤抑制等关键生物学过程。IRF1在多种细胞类型中表达,其功能异常与多种疾病相关,包括癌症、自身免疫性疾病和病毒感染。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
胃癌 IRF1表达下调或功能缺失可能导致肿瘤免疫逃逸和细胞增殖失控,促进胃癌发生发展。 较强研究证据
肝细胞癌 IRF1在肝癌中表达降低,可能通过影响免疫监视和细胞凋亡参与肝癌进展。 较强研究证据
乳腺癌 IRF1表达异常与乳腺癌预后相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤生长。 较强研究证据
慢性髓性白血病 IRF1位于5q31.1,该区域缺失与CML进展相关,IRF1可能作为肿瘤抑制因子。 较强研究证据
自身免疫性疾病 IRF1参与免疫调节,其多态性可能与某些自身免疫性疾病易感性相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs839 SNV 暂无可靠数据 可能影响IRF1表达或功能,与疾病关联待研究
rs17622660 SNV 暂无可靠数据 位于启动子区域,可能影响转录活性
缺失突变 CNV 暂无可靠数据 5q31.1区域缺失导致IRF1单倍剂量不足,与白血病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致IRF1蛋白表达减少或功能丧失,可能削弱肿瘤抑制和免疫调节功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明IRF1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:暂无明确证据表明IRF1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006915 apoptotic process
• GO:0006955 immune response • GO:0007165 signal transduction
• GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

Interferon gamma signaling (Reactome: R-HSA-877300)
Cytokine Signaling in Immune system (Reactome: R-HSA-1280215)
Apoptosis (KEGG: hsa04210)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

IRF1蛋白由325个氨基酸组成,包含N端的DNA结合结构域和C端的转录激活结构域。作为转录因子,IRF1结合到靶基因启动子区的干扰素刺激反应元件(ISRE)上,调控基因表达。IRF1在干扰素信号通路中发挥关键作用,通过诱导多种干扰素刺激基因(ISG)的表达,参与抗病毒、抗肿瘤和免疫调节。此外,IRF1还通过调控细胞周期和凋亡相关基因,抑制肿瘤细胞增殖。

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