IRF4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IRF4是免疫系统关键转录因子,调控B细胞、T细胞分化及免疫应答,与多发性骨髓瘤等疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 IRF4
基因全名 interferon regulatory factor 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p25.3
NCBI Gene ID 3662 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3662
Ensembl ID ENSG00000137265
UniProt ID Q15306
OMIM ID 601900
HGNC ID 6116
基因别名 MUM1, NF-EM5, LSIRF, SHEP8

基因功能与研究简介

IRF4(干扰素调节因子4)是干扰素调节因子(IRF)家族成员,主要在免疫细胞中表达,作为转录因子调控多种基因表达。IRF4在B细胞、T细胞、浆细胞和巨噬细胞的分化与功能中发挥关键作用,参与免疫应答、炎症反应和肿瘤发生。IRF4通过结合干扰素刺激反应元件(ISRE)和Ets/IRF复合元件(EICE)调控靶基因。IRF4的异常表达或突变与多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞白血病、T细胞淋巴瘤等血液肿瘤密切相关,也是免疫治疗的重要靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
多发性骨髓瘤 IRF4易位或过表达导致MYC等靶基因激活,促进肿瘤增殖 已明确致病
慢性淋巴细胞白血病 IRF4突变或表达异常影响B细胞受体信号,参与疾病发生 具有较强研究证据
T细胞淋巴瘤 IRF4重排或过表达与皮肤T细胞淋巴瘤等亚型相关 具有较强研究证据
免疫缺陷 IRF4功能缺失突变导致免疫缺陷,影响抗体产生和T细胞功能 已明确致病
系统性红斑狼疮 IRF4多态性影响自身免疫反应,增加疾病风险 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 高表达
淋巴结 暂无可靠数据 高表达
外周血 暂无可靠数据 中等表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Ramos (Burkitt淋巴瘤) 暂无可靠数据 B细胞系,高表达
Jurkat (T细胞白血病) 暂无可靠数据 T细胞系,中等表达
U266 (骨髓瘤) 暂无可靠数据 骨髓瘤细胞系,高表达
THP-1 (单核细胞白血病) 暂无可靠数据 单核细胞系,低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
IRF4 K123R 错义突变 罕见 可能影响DNA结合,导致功能改变
IRF4 L116P 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能丧失
IRF4 易位 染色体易位 多发性骨髓瘤中常见 导致IRF4过表达,激活MYC等靶基因
IRF4 缺失 拷贝数缺失 罕见 导致单倍剂量不足,影响免疫功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

IRF4功能缺失突变(如L116P)导致蛋白结构改变,影响DNA结合和转录激活能力,导致免疫缺陷。

Gain of Function(功能获得,GOF)

IRF4易位或过表达(如多发性骨髓瘤中的t(6;14))导致蛋白过表达,增强靶基因转录,促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity
• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006955 immune response • GO:0045893 positive regulation of transcription
• DNA-templated

相关通路

B cell receptor signaling pathway
T cell receptor signaling pathway
Plasma cell differentiation
Toll-like receptor signaling pathway

蛋白质功能简介

IRF4蛋白由451个氨基酸组成,包含N端的DNA结合域(DBD)和C端的IRF关联域(IAD)。DBD介导与DNA的ISRE/EICE序列结合,IAD介导与其他转录因子(如PU.1、SPI-B)的相互作用。IRF4在细胞核内发挥转录激活或抑制作用,调控靶基因表达。IRF4在浆细胞分化中至关重要,调控Blimp-1和XBP1等关键基因。在T细胞中,IRF4参与Th2、Th17和Tfh细胞分化。IRF4的异常表达与多种血液肿瘤相关,是潜在的治疗靶点。

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