IRX3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

IRX3是参与神经发育和代谢调控的关键转录因子,其变异与肥胖、2型糖尿病等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 IRX3
基因全名 iroquois homeobox 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q12.2
NCBI Gene ID 79191 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79191
Ensembl ID ENSG00000177508
UniProt ID Q96AT1
OMIM ID 612585
HGNC ID 15972
基因别名 IRX-3; Iroquois homeobox protein 3

基因功能与研究简介

IRX3基因编码Iroquois同源框蛋白3,属于Iroquois家族转录因子,在神经发育、心脏发育和代谢调控中发挥重要作用。IRX3在脂肪组织、下丘脑等部位表达,参与调控能量代谢和脂肪生成。全基因组关联研究(GWAS)发现IRX3附近的变异与肥胖和2型糖尿病风险相关,后续功能研究表明IRX3是这些关联的功能效应基因。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肥胖 IRX3表达水平影响脂肪组织能量消耗,变异可能通过调控IRX3表达影响肥胖风险。 GWAS关联,功能研究
2型糖尿病 IRX3变异与2型糖尿病风险相关,可能通过影响胰岛素敏感性和β细胞功能。 GWAS关联
神经发育异常 IRX3在神经发育中表达,可能参与脑发育相关疾病,但证据有限。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脂肪组织 暂无可靠数据 IRX3在脂肪组织中有表达,但具体nTPM值未提供
下丘脑 暂无可靠数据 IRX3在下丘脑表达,参与能量平衡调控
心脏 暂无可靠数据 IRX3在心脏发育中表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
脂肪细胞 暂无可靠数据 IRX3在脂肪细胞中表达,调控脂肪生成
神经元 暂无可靠数据 IRX3在神经元中表达,参与神经发育
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs1421085 SNP 风险等位基因频率约0.4 位于FTO基因内含子,与IRX3表达调控相关,可能影响肥胖风险
rs8050136 SNP 风险等位基因频率约0.4 与IRX3表达相关,影响肥胖风险
rs9939609 SNP 风险等位基因频率约0.4 与IRX3表达相关,影响肥胖风险
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

IRX3功能缺失可能导致神经发育异常或代谢紊乱,但具体证据有限。

Gain of Function(功能获得,GOF)

IRX3功能获得可能增加脂肪生成,导致肥胖风险增加。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0007275 (multicellular organism development) • GO:0042593 (glucose homeostasis)

相关通路

hsa04922 (Glucagon signaling pathway)
hsa04923 (Regulation of lipolysis in adipocytes)

蛋白质功能简介

IRX3蛋白属于Iroquois同源框家族,包含同源结构域,作为转录因子调控下游基因表达。在脂肪组织中,IRX3可能通过调控能量消耗相关基因影响肥胖。在神经系统中,IRX3参与神经元的发育和分化。

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