ISY1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ISY1基因编码剪接体复合物组分,参与mRNA剪接调控,其突变与神经发育障碍和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ISY1 |
|---|---|
| 基因全名 | ISY1 splicing factor homolog |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q21.1 |
| NCBI Gene ID | 57462 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57462 |
| Ensembl ID | ENSG00000114544 |
| UniProt ID | Q9H0U4 |
| OMIM ID | 609209 |
| HGNC ID | 18573 |
| 基因别名 | ISY1-RAB43, ISY1 splicing factor homolog, DKFZp686K05120 |
基因功能与研究简介
ISY1基因编码剪接体复合物的一个组分,参与前体mRNA的剪接过程。该蛋白与PRPF19等剪接因子相互作用,在剪接体的组装和催化中发挥作用。ISY1的异常表达或突变可能影响RNA剪接的准确性,进而导致多种疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | ISY1突变可能导致剪接异常,影响神经发育相关基因的表达,与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 | ClinVar |
| 癌症 | ISY1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤相关基因,参与肿瘤发生发展。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,可能引起剪接异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005681 spliceosomal complex | • GO:0000398 mRNA splicing |
| • via spliceosome | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• Spliceosome (hsa03040)
蛋白质功能简介
ISY1蛋白是剪接体复合物的组分,参与前体mRNA剪接的催化步骤。它可能通过与其他剪接因子相互作用,调节剪接体的组装和活性。ISY1的异常可能导致剪接异常,进而影响细胞功能。