ITGB6基因|整合素β6功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ITGB6编码整合素β6亚基,参与上皮形态发生、组织修复及纤维化过程,其突变与先天性缺指/缺趾畸形等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | ITGB6 |
|---|---|
| 基因全名 | integrin subunit beta 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q24.2 |
| NCBI Gene ID | 3694 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3694 |
| Ensembl ID | ENSG00000115221 |
| UniProt ID | P18564 |
| OMIM ID | 147558 |
| HGNC ID | 6155 |
| 基因别名 | 整合素β6亚基 |
基因功能与研究简介
ITGB6基因编码整合素β6亚基,是整合素家族成员之一。整合素是细胞表面重要的黏附分子,介导细胞与细胞外基质(ECM)的相互作用,参与细胞黏附、迁移、增殖、分化及凋亡等过程。ITGB6与αv亚基形成异二聚体αvβ6,主要在上皮细胞中表达,在正常组织中表达水平较低,但在组织损伤、炎症及肿瘤发生过程中表达上调。αvβ6整合素可结合纤连蛋白、玻连蛋白等ECM蛋白,并激活TGF-β信号通路,参与组织纤维化、伤口愈合及肿瘤进展等过程。ITGB6基因突变可导致先天性缺指/缺趾畸形(split-hand/foot malformation, SHFM)等疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性缺指/缺趾畸形 | ITGB6基因突变导致αvβ6整合素功能异常,影响胚胎发育过程中指/趾的形成,导致SHFM。 | 已明确致病 |
| 牙釉质发育不全 | ITGB6基因突变可能影响牙釉质形成,导致釉质发育不全。 | 具有较强研究证据 |
| 癌症相关 | ITGB6在多种上皮来源的肿瘤中高表达,与肿瘤侵袭、转移及不良预后相关。 | 癌症相关 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺腺癌细胞系 |
| HaCaT | 暂无可靠数据 | 角质形成细胞系 |
| MCF-7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1225C>T (p.Arg409Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1378G>A (p.Gly460Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响待研究 |
| c.1666C>T (p.Arg556Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致ITGB6蛋白功能部分或完全丧失,如无义突变、移码突变等。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明ITGB6存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明ITGB6存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155(细胞黏附) | • GO:0007229(整合素介导的信号通路) |
| • GO:0005886(质膜) | • GO:0008305(整合素复合物) |
| • GO:0005178(整合素结合) |
相关通路
• hsa04510(Focal adhesion)
• hsa04512(ECM-receptor interaction)
• hsa04350(TGF-beta signaling pathway)
蛋白质功能简介
ITGB6蛋白是整合素β6亚基,与αv亚基形成异二聚体αvβ6。该蛋白主要在上皮细胞中表达,在正常组织中表达水平较低,但在组织损伤、炎症及肿瘤发生过程中表达上调。αvβ6整合素可结合纤连蛋白、玻连蛋白等ECM蛋白,并激活TGF-β信号通路,参与组织纤维化、伤口愈合及肿瘤进展等过程。ITGB6蛋白包含一个胞外配体结合域、一个跨膜域和一个胞内域,胞内域与细胞骨架蛋白相互作用,传递信号。