ITM2C基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

ITM2C(Integral Membrane Protein 2C)是一种参与淀粉样前体蛋白加工和神经退行性疾病相关的跨膜蛋白,其突变与遗传性痴呆和脑铁沉积有关。

基因信息卡

基因符号 ITM2C
基因全名 Integral Membrane Protein 2C
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q37.1
NCBI Gene ID 81618 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81618
Ensembl ID ENSG00000135916
UniProt ID Q9UKU0
OMIM ID 608901
HGNC ID 6174
基因别名 BRICD2B, E25B, ITM3

基因功能与研究简介

ITM2C(Integral Membrane Protein 2C)基因编码一种跨膜蛋白,属于ITM2家族。该蛋白在脑中高表达,参与淀粉样前体蛋白(APP)的加工过程,可能影响β-淀粉样肽的产生。ITM2C的突变与遗传性弥漫性白质脑病合并轴索球样变(HDLS)和脑铁沉积神经变性病(NBIA)相关。此外,ITM2C在细胞分化、凋亡和免疫应答中也可能发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性弥漫性白质脑病合并轴索球样变(HDLS) ITM2C突变导致蛋白功能异常,影响APP加工,导致白质病变和轴索球样变。 已明确致病
脑铁沉积神经变性病(NBIA) ITM2C突变可能影响铁代谢或髓鞘形成,导致脑内铁沉积和神经变性。 具有较强研究证据
阿尔茨海默病(AD) ITM2C参与APP加工,可能影响Aβ产生,与AD风险相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.442C>T (p.Arg148Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.494G>A (p.Trp165Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.560G>A (p.Arg187His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,丧失正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0016021 integral component of membrane • GO:0042981 regulation of apoptotic process

相关通路

Amyloid precursor protein processing (Reactome: R-HSA-977225)
Alzheimer's disease pathway (KEGG: hsa05010)

蛋白质功能简介

ITM2C蛋白是一种跨膜蛋白,包含一个BRICHOS结构域,该结构域在多种与神经退行性疾病相关的蛋白中发现。ITM2C在脑中高表达,定位于内质网和高尔基体,参与APP的加工,可能通过影响γ-分泌酶活性调节Aβ的产生。此外,ITM2C还参与细胞凋亡和免疫应答的调控。

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