ITPKC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

ITPKC(肌醇-1,4,5-三磷酸3-激酶C)在钙信号调控中发挥关键作用,其突变与川崎病和自身免疫疾病相关。

基因信息卡

基因符号 ITPKC
基因全名 Inositol-trisphosphate 3-kinase C
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.2
NCBI Gene ID 80271 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80271
Ensembl ID ENSG00000105655
UniProt ID Q96F25
OMIM ID 605994
HGNC ID 15945
基因别名 IP3KC, IP3-3KC, IP3K C

基因功能与研究简介

ITPKC基因编码肌醇-1,4,5-三磷酸3-激酶C,该酶催化IP3磷酸化为IP4,从而调节细胞内钙离子信号通路。ITPKC在免疫细胞中高表达,参与T细胞活化和炎症反应。研究表明,ITPKC基因的变异与川崎病的易感性相关,可能通过影响钙信号传导和NFAT通路来调节免疫应答。此外,ITPKC可能与其他自身免疫疾病相关,但证据尚不充分。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
川崎病 ITPKC基因的变异(如rs28493229)可能通过影响mRNA剪接或蛋白表达,导致钙信号通路异常,进而影响免疫细胞功能,增加川崎病风险。 已明确致病(关联)
自身免疫疾病(如系统性红斑狼疮) ITPKC可能参与调节T细胞活化和炎症因子产生,其变异可能增加自身免疫疾病风险,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
外周血 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
淋巴结 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat T细胞 暂无可靠数据 高表达
THP-1单核细胞 暂无可靠数据 中等表达
HEK293 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs28493229 (C>G) SNP 亚洲人群频率约0.2 可能影响mRNA剪接,导致蛋白表达降低,与川崎病风险增加相关
c.126G>A (p.Met42Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

ITPKC的某些变异可能导致蛋白表达降低或酶活性减弱,从而影响IP3代谢和钙信号传导,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明ITPKC存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明ITPKC存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000166 - nucleotide binding • GO:0005524 - ATP binding
• GO:0005737 - cytoplasm • GO:0005829 - cytosol
• GO:0008440 - inositol-1 • 4
• 5-trisphosphate 3-kinase activity • GO:0016020 - membrane
• GO:0035556 - intracellular signal transduction • GO:0048015 - phosphatidylinositol-mediated signaling

相关通路

Inositol phosphate metabolism (Reactome: R-HSA-1483249)
DAG and IP3 signaling (Reactome: R-HSA-1489509)
NFAT activation in T cells (Reactome: R-HSA-202403)

蛋白质功能简介

ITPKC蛋白属于肌醇-1,4,5-三磷酸3-激酶家族,主要催化IP3的磷酸化,生成IP4,从而调节细胞内钙离子浓度。该蛋白在免疫细胞中高表达,参与T细胞受体信号通路和NFAT转录因子的激活。ITPKC的异常表达或功能缺陷可能导致钙信号失调,进而影响免疫应答,与川崎病等疾病相关。

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