JADE2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
JADE2是PHD指蛋白家族成员,作为HBO1组蛋白乙酰转移酶复合物的亚基,调控基因转录、细胞周期和DNA损伤修复,与多种癌症和神经发育相关。
基因信息卡
| 基因符号 | JADE2 |
|---|---|
| 基因全名 | jade family PHD finger 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q31.1 |
| NCBI Gene ID | 23338 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23338 |
| Ensembl ID | ENSG00000113575 |
| UniProt ID | Q75QN2 |
| OMIM ID | 614989 |
| HGNC ID | 22984 |
| 基因别名 | KIAA0239, FLJ14154, MGC138162 |
基因功能与研究简介
JADE2(jade family PHD finger 2)基因编码一种PHD指蛋白,是HBO1组蛋白乙酰转移酶复合物的核心亚基之一。该复合物通过乙酰化组蛋白H3和H4,调控染色质结构和基因转录。JADE2在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞凋亡和发育过程中发挥重要作用。研究表明,JADE2的表达异常与多种癌症(如乳腺癌、肺癌、肝癌)和神经系统疾病相关。此外,JADE2还参与调控细胞自噬和代谢。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | JADE2在乳腺癌中表达上调,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | JADE2在非小细胞肺癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和DNA修复促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | JADE2在肝癌组织中表达升高,可能通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤侵袭。 | 较强研究证据 |
| 神经发育异常 | JADE2基因突变与自闭症谱系障碍和智力障碍相关,可能通过影响神经元基因表达和突触可塑性。 | 潜在关联 |
| 卵巢癌 | JADE2在卵巢癌中表达异常,可能参与肿瘤耐药。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1567A>G (p.Lys523Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1789_1790insA (p.Thr597AsnfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致JADE2蛋白功能丧失或减弱,可能影响HBO1复合物活性,导致基因转录异常和细胞周期失调。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,目前暂无明确证据表明JADE2存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,目前暂无明确证据表明JADE2存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006325 chromatin organization | • GO:0006351 transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0008283 cell proliferation |
| • GO:0016573 histone acetylation | • GO:0035264 multicellular organism growth |
| • GO:0043066 negative regulation of apoptotic process | • GO:0045893 positive regulation of transcription |
| • DNA-templated |
相关通路
• hsa05200 Pathways in cancer
• hsa04110 Cell cycle
• hsa03440 Homologous recombination
• hsa03420 Nucleotide excision repair
• hsa05034 Alcoholism
蛋白质功能简介
JADE2蛋白包含一个PHD指结构域,该结构域介导与组蛋白H3K4me3的结合,从而将HBO1复合物招募至特定基因启动子区域。JADE2作为HBO1复合物的亚基,促进组蛋白H3和H4的乙酰化,进而激活基因转录。此外,JADE2还参与DNA损伤应答,通过调控p53的乙酰化影响细胞凋亡和细胞周期检查点。JADE2的异常表达或突变可能导致基因表达失调,与肿瘤发生和神经发育异常相关。