JAGN1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
JAGN1是中性粒细胞分化与功能的关键调控因子,其突变可导致先天性中性粒细胞减少症。
基因信息卡
| 基因符号 | JAGN1 |
|---|---|
| 基因全名 | jagunal homolog 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p25.3 |
| NCBI Gene ID | 84522 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84522 |
| Ensembl ID | ENSG00000114544 |
| UniProt ID | Q8N5M9 |
| OMIM ID | 616012 |
| HGNC ID | 26953 |
| 基因别名 | JAGN1, C3orf59, JAGN1 homolog |
基因功能与研究简介
JAGN1基因编码一种内质网定位的蛋白,参与中性粒细胞的分化和功能。研究表明,JAGN1对于中性粒细胞颗粒蛋白的成熟和分泌至关重要,其功能缺失会导致中性粒细胞减少症。JAGN1突变与先天性中性粒细胞减少症(Severe Congenital Neutropenia)相关,该疾病以反复感染为特征。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性中性粒细胞减少症 | JAGN1突变导致中性粒细胞分化受阻,颗粒蛋白合成异常,引起中性粒细胞减少和功能障碍。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征 | 部分JAGN1突变患者可能进展为骨髓增生异常综合征,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 中性粒细胞样细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3G>A (p.Met1Ile) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.43C>T (p.Arg15Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.118G>A (p.Gly40Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能受损 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
JAGN1突变导致蛋白功能丧失,影响中性粒细胞分化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0003674 (molecular_function) |
| • GO:0005575 (cellular_component) |
相关通路
• Neutrophil degranulation (Reactome: R-HSA-6798695)
蛋白质功能简介
JAGN1蛋白定位于内质网,参与中性粒细胞颗粒蛋白的合成与加工。其功能缺失导致中性粒细胞颗粒蛋白异常,影响中性粒细胞杀菌能力。