JMJD4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

JMJD4编码JmjC结构域蛋白,可能参与组蛋白去甲基化,与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 JMJD4
基因全名 jumonji domain containing 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q42.13
NCBI Gene ID 65094 ncbi.nlm.nih.gov/gene/65094
Ensembl ID ENSG00000197956
UniProt ID Q9H1Z4
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:29371
基因别名 FLJ12770

基因功能与研究简介

JMJD4(jumonji domain containing 4)编码一个含有JmjC结构域的蛋白质,该结构域在许多组蛋白去甲基化酶中存在。JMJD4可能参与组蛋白赖氨酸残基的去甲基化,从而调控基因表达。研究表明,JMJD4在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤的发生和发展。然而,其具体功能和底物尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 JMJD4在多种癌症中表达上调,可能通过调控基因表达促进肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 具有较强研究证据
暂无明确疾病关联 目前尚无JMJD4直接致病的单基因疾病报道。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456C>T (p.S152F) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致JMJD4蛋白活性降低或丧失,可能影响其底物的去甲基化,进而影响基因表达调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强JMJD4的酶活性或改变其底物特异性,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能产生无功能的JMJD4蛋白,干扰正常蛋白的功能,但具体证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0008168 methyltransferase activity
• GO:0032451 demethylase activity

相关通路

暂无可靠数据

蛋白质功能简介

JMJD4蛋白含有JmjC结构域,该结构域在许多组蛋白去甲基化酶中保守。JMJD4可能作为组蛋白去甲基化酶,通过去除组蛋白赖氨酸残基上的甲基基团来调控基因表达。然而,其具体底物和生物学功能尚未完全阐明。研究表明,JMJD4在多种癌症中表达上调,可能通过调控基因表达促进肿瘤发生发展。

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