KARS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KARS1编码赖氨酰-tRNA合成酶,是蛋白质合成和线粒体功能的关键酶,其突变可导致神经病变和线粒体疾病。

基因信息卡

基因符号 KARS1
基因全名 lysyl-tRNA synthetase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q23.1
NCBI Gene ID 3735 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3735
Ensembl ID ENSG00000065427
UniProt ID Q15046
OMIM ID 601421
HGNC ID 6215
基因别名 KARS, KARS2, LysRS, KIAA0070

基因功能与研究简介

KARS1基因编码赖氨酰-tRNA合成酶,该酶催化赖氨酸与对应tRNA的结合,是蛋白质合成中的关键步骤。KARS1在细胞质和线粒体中均有定位,参与线粒体蛋白质合成。KARS1突变可导致多种疾病,包括周围神经病变、听力损失和线粒体疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体隐性遗传中间型腓骨肌萎缩症(CMTRIB) KARS1突变导致酶活性降低,影响蛋白质合成,导致神经病变 已明确致病
常染色体隐性遗传非综合征性听力损失(DFNB89) KARS1突变影响内耳毛细胞功能,导致听力损失 已明确致病
线粒体疾病(如线粒体脑肌病) KARS1突变影响线粒体蛋白质合成,导致线粒体功能障碍 具有较强研究证据
癌症(如结直肠癌) KARS1表达异常可能影响肿瘤细胞增殖和转移 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SH-SY5Y 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1129A>G (p.Thr377Ala) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.1490C>T (p.Pro497Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质稳定性
c.1696G>A (p.Glu566Lys) 错义突变 罕见 可能影响底物结合
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

KARS1突变导致酶活性降低或丧失,影响蛋白质合成,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明KARS1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明KARS1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004824 (lysine-tRNA ligase activity) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005739 (mitochondrion) • GO:0006418 (tRNA aminoacylation for protein translation)

相关通路

Aminoacyl-tRNA biosynthesis (KEGG: hsa00970)
Mitochondrial translation (Reactome: R-HSA-5368287)

蛋白质功能简介

KARS1编码的赖氨酰-tRNA合成酶(LysRS)是氨酰-tRNA合成酶家族成员,催化赖氨酸与tRNA(Lys)的结合。该酶在细胞质和线粒体中均存在,参与蛋白质合成。LysRS还参与多种细胞过程,如信号转导和基因表达调控。KARS1突变可导致酶活性降低,影响蛋白质合成,进而导致神经病变和线粒体疾病。

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