KCNIP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KCNIP3(钾电压门控通道相互作用蛋白3)是调控神经元兴奋性和心脏电信号的关键蛋白,与神经系统疾病和心脏疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 KCNIP3
基因全名 Potassium voltage-gated channel interacting protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q21.1
NCBI Gene ID 30818 ncbi.nlm.nih.gov/gene/30818
Ensembl ID ENSG00000115073
UniProt ID Q9Y2W7
OMIM ID 604662
HGNC ID 15522
基因别名 CSEN, DREAM, KCHIP3

基因功能与研究简介

KCNIP3(钾电压门控通道相互作用蛋白3)编码一种钙结合蛋白,属于KChIP家族。该蛋白含有四个EF-hand结构域,能够结合钙离子,并作为钾电压门控通道(Kv4)的辅助亚基,调节通道的细胞表面表达和门控特性。KCNIP3在脑和心脏中高表达,参与调控神经元兴奋性、突触可塑性以及心肌细胞的复极化。此外,KCNIP3还作为转录抑制因子,通过与DNA结合调节基因表达。KCNIP3的异常表达或突变与神经系统疾病(如阿尔茨海默病、癫痫)和心脏疾病(如长QT综合征)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
阿尔茨海默病 KCNIP3(DREAM)在阿尔茨海默病中表达下调,可能通过影响钙稳态和突触功能参与疾病进展。 研究证据
癫痫 KCNIP3突变或表达异常可能影响Kv4通道功能,导致神经元过度兴奋,与癫痫发病相关。 研究证据
长QT综合征 KCNIP3突变可能影响心脏Kv4通道功能,导致心肌复极化异常,增加心律失常风险。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
HL-1 暂无可靠数据 小鼠心肌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.458C>T (p.Pro153Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.742G>A (p.Val248Met) 错义突变 罕见 可能影响钙结合能力,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致KCNIP3蛋白功能丧失或降低,可能影响Kv4通道调控和转录抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:导致KCNIP3蛋白功能增强,可能增强Kv4通道活性或转录抑制作用。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常蛋白功能,可能通过形成无功能二聚体或竞争性结合靶标。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005509 calcium ion binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0006811 ion transport • GO:0006813 potassium ion transport
• GO:0005244 voltage-gated potassium channel activity • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0005634 nucleus • GO:0046872 metal ion binding

相关通路

hsa04260 Cardiac muscle contraction
hsa04724 Glutamatergic synapse
hsa05010 Alzheimer's disease

蛋白质功能简介

KCNIP3蛋白由256个氨基酸组成,分子量约29 kDa。该蛋白含有四个EF-hand钙结合结构域,能够结合钙离子并发生构象变化。KCNIP3作为Kv4钾通道的辅助亚基,调节通道的细胞表面表达、门控动力学和电压依赖性。此外,KCNIP3还作为转录抑制因子,通过与DNA结合调节基因表达,参与神经元和心肌细胞的信号调控。

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