KCNT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KCNT1基因编码钠激活钾通道,其突变与癫痫和智力障碍等神经系统疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 KCNT1
基因全名 potassium sodium-activated channel subfamily T member 1
基因类型 protein coding
染色体位置 9q34.3
NCBI Gene ID 57582 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57582
Ensembl ID ENSG00000107147
UniProt ID Q5JUK3
OMIM ID 608167
HGNC ID 18865
基因别名 SLACK, KCa4.1, KIAA1422

基因功能与研究简介

KCNT1基因编码钠激活钾通道亚家族T成员1(Slack),属于钾通道家族。该通道在神经元中高表达,参与调控神经元兴奋性、动作电位复极化和放电频率。KCNT1突变可导致通道功能增强(gain-of-function),引起多种神经系统疾病,包括婴儿期恶性迁移性部分性癫痫(MMPSI)、常染色体显性夜间额叶癫痫(ADNFLE)和伴有智力障碍的癫痫。此外,KCNT1在多种癌症中异常表达,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
婴儿期恶性迁移性部分性癫痫(MMPSI) KCNT1功能增强突变导致通道过度激活,增加神经元兴奋性,引发癫痫 已明确致病
常染色体显性夜间额叶癫痫(ADNFLE) KCNT1功能增强突变导致通道过度激活,增加神经元兴奋性,引发癫痫 已明确致病
伴有智力障碍的癫痫 KCNT1突变影响神经元功能,导致智力障碍和癫痫 具有较强研究证据
自闭症谱系障碍 KCNT1突变可能影响神经元兴奋性,与自闭症相关 潜在关联
癌症 KCNT1在多种肿瘤中异常表达,可能参与肿瘤增殖和迁移 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.862G>A (p.Gly288Ser) 错义突变 罕见 功能增强(gain-of-function)
c.1195A>G (p.Ile399Val) 错义突变 罕见 功能增强(gain-of-function)
c.2386C>T (p.Arg796Cys) 错义突变 罕见 功能增强(gain-of-function)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明KCNT1突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

多数致病突变导致通道功能增强,增加钾电流,使神经元过度兴奋。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明KCNT1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005267 (potassium channel activity) • GO:0006813 (potassium ion transport)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Potassium channel activity
Neuronal signaling

蛋白质功能简介

KCNT1蛋白(Slack)是钠激活钾通道的成孔亚基,由KCNT1基因编码。该通道在神经元中高表达,参与调控神经元兴奋性。通道由四个KCNT1亚基组成,可被细胞内钠离子激活,产生外向钾电流,促进动作电位复极化和调节放电频率。KCNT1突变导致通道功能增强,增加钾电流,使神经元过度兴奋,从而引发癫痫等疾病。

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