KCTD11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KCTD11(钾通道四聚化结构域蛋白11)是Hedgehog信号通路的负调控因子,在多种癌症中表达下调,与肿瘤发生密切相关。

基因信息卡

基因符号 KCTD11
基因全名 potassium channel tetramerization domain containing 11
基因类型 protein-coding
染色体位置 17p13.1
NCBI Gene ID 147040 ncbi.nlm.nih.gov/gene/147040
Ensembl ID ENSG00000108691
UniProt ID Q693B1
OMIM ID 609780
HGNC ID 21358
基因别名 KCASH1, REN

基因功能与研究简介

KCTD11(钾通道四聚化结构域蛋白11)属于KCTD家族,含有BTB/POZ结构域。该蛋白作为Cullin3-RING E3泛素连接酶的底物受体,参与Hedgehog信号通路的负调控。KCTD11通过促进GLI转录因子的泛素化和降解,抑制Hedgehog靶基因的表达。在多种肿瘤中,KCTD11表达下调或缺失,导致Hedgehog通路异常激活,促进肿瘤细胞增殖和存活。此外,KCTD11还参与细胞周期调控和凋亡。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
髓母细胞瘤 KCTD11表达下调导致Hedgehog通路异常激活,促进肿瘤发生 已明确致病
肝细胞癌 KCTD11表达下调与肿瘤进展和不良预后相关 具有较强研究证据
结直肠癌 KCTD11表达下调可能参与肿瘤发生 潜在关联
肺癌 KCTD11表达下调与肿瘤发生相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
DAOY(髓母细胞瘤细胞系) 暂无可靠数据 KCTD11表达下调
HepG2(肝癌细胞系) 暂无可靠数据 KCTD11表达下调
HCT116(结直肠癌细胞系) 暂无可靠数据 KCTD11表达下调
A549(肺癌细胞系) 暂无可靠数据 KCTD11表达下调
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.250C>T (p.Arg84Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.400_401insA (p.Thr134AsnfsTer2) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致KCTD11蛋白表达减少或功能缺失,从而解除对Hedgehog通路的抑制,促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明KCTD11存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明KCTD11存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process
• GO:0007224 smoothened signaling pathway • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm

相关通路

Hedgehog signaling pathway (hsa04340)

蛋白质功能简介

KCTD11蛋白由257个氨基酸组成,包含一个BTB/POZ结构域,该结构域介导蛋白-蛋白相互作用和Cullin3结合。KCTD11作为Cullin3-RING E3泛素连接酶的底物受体,特异性识别GLI转录因子并促进其泛素化降解,从而负调控Hedgehog信号通路。此外,KCTD11还参与细胞周期调控和凋亡,其表达下调与多种肿瘤的发生发展相关。

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