KCTD11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
KCTD11(钾通道四聚化结构域蛋白11)是Hedgehog信号通路的负调控因子,在多种癌症中表达下调,与肿瘤发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | KCTD11 |
|---|---|
| 基因全名 | potassium channel tetramerization domain containing 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17p13.1 |
| NCBI Gene ID | 147040 ncbi.nlm.nih.gov/gene/147040 |
| Ensembl ID | ENSG00000108691 |
| UniProt ID | Q693B1 |
| OMIM ID | 609780 |
| HGNC ID | 21358 |
| 基因别名 | KCASH1, REN |
基因功能与研究简介
KCTD11(钾通道四聚化结构域蛋白11)属于KCTD家族,含有BTB/POZ结构域。该蛋白作为Cullin3-RING E3泛素连接酶的底物受体,参与Hedgehog信号通路的负调控。KCTD11通过促进GLI转录因子的泛素化和降解,抑制Hedgehog靶基因的表达。在多种肿瘤中,KCTD11表达下调或缺失,导致Hedgehog通路异常激活,促进肿瘤细胞增殖和存活。此外,KCTD11还参与细胞周期调控和凋亡。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 髓母细胞瘤 | KCTD11表达下调导致Hedgehog通路异常激活,促进肿瘤发生 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | KCTD11表达下调与肿瘤进展和不良预后相关 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | KCTD11表达下调可能参与肿瘤发生 | 潜在关联 |
| 肺癌 | KCTD11表达下调与肿瘤发生相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| DAOY(髓母细胞瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | KCTD11表达下调 |
| HepG2(肝癌细胞系) | 暂无可靠数据 | KCTD11表达下调 |
| HCT116(结直肠癌细胞系) | 暂无可靠数据 | KCTD11表达下调 |
| A549(肺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | KCTD11表达下调 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.250C>T (p.Arg84Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.400_401insA (p.Thr134AsnfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致KCTD11蛋白表达减少或功能缺失,从而解除对Hedgehog通路的抑制,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明KCTD11存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明KCTD11存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0007224 smoothened signaling pathway | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (hsa04340)
蛋白质功能简介
KCTD11蛋白由257个氨基酸组成,包含一个BTB/POZ结构域,该结构域介导蛋白-蛋白相互作用和Cullin3结合。KCTD11作为Cullin3-RING E3泛素连接酶的底物受体,特异性识别GLI转录因子并促进其泛素化降解,从而负调控Hedgehog信号通路。此外,KCTD11还参与细胞周期调控和凋亡,其表达下调与多种肿瘤的发生发展相关。