KDM6A基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
KDM6A编码组蛋白去甲基化酶，参与基因表达调控，其突变与多种发育性疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | KDM6A |
|---|---|
| 基因全名 | Lysine Demethylase 6A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xp11.3 |
| NCBI Gene ID | 7403 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7403 |
| Ensembl ID | ENSG00000147050 |
| UniProt ID | O15550 |
| OMIM ID | 300128 |
| HGNC ID | 12637 |
| 基因别名 | UTX; MGC141912; bA386N14.2 |
基因功能与研究简介
KDM6A（Lysine Demethylase 6A）编码一种组蛋白去甲基化酶，特异性去除组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化（H3K27me3）和二甲基化（H3K27me2），从而激活基因转录。KDM6A是COMPASS复合物的组成部分，参与胚胎发育、细胞分化和基因表达调控。KDM6A位于X染色体，但逃避X失活，其功能缺失突变与Kabuki综合征及多种癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Kabuki综合征 | KDM6A功能缺失突变导致H3K27me3水平异常，影响基因表达，导致多系统发育异常。 | 已明确致病 |
| 多发性骨髓瘤 | KDM6A突变或表达下调与多发性骨髓瘤的发生发展相关。 | 具有较强研究证据 |
| 膀胱癌 | KDM6A在膀胱癌中频繁突变，可能作为肿瘤抑制因子。 | 癌症相关 |
| 食管鳞状细胞癌 | KDM6A突变与食管鳞状细胞癌相关。 | 癌症相关 |
| 胰腺癌 | KDM6A突变在胰腺癌中检出，可能参与肿瘤发生。 | 癌症相关 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2973_2974del (p.Glu992fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3610C>T (p.Arg1204*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2542G>A (p.Gly848Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失突变，导致KDM6A蛋白失活或截短，丧失去甲基化酶活性，导致H3K27me3水平升高，基因表达异常。
Gain of Function（功能获得，GOF）
目前暂无明确证据表明KDM6A存在功能获得性突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
目前暂无明确证据表明KDM6A存在显性负性突变。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 | • GO:0005634 |
| • GO:0006338 | • GO:0032453 |
| • GO:0046872 |
相关通路
• hsa05200
• hsa05202
• hsa05205
蛋白质功能简介
KDM6A蛋白属于组蛋白去甲基化酶家族，包含JmjC结构域，能够催化H3K27me3/me2的去甲基化。KDM6A作为COMPASS复合物的组分，参与基因转录激活。在发育过程中，KDM6A调控HOX基因等关键基因的表达。KDM6A突变导致其酶活性丧失，影响细胞分化，与Kabuki综合征和多种癌症相关。
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