KDM7A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KDM7A是一种组蛋白去甲基化酶,参与基因表达调控,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 KDM7A
基因全名 lysine demethylase 7A
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q34
NCBI Gene ID 80853 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80853
Ensembl ID ENSG00000106462
UniProt ID Q6ZMT4
OMIM ID 611072
HGNC ID 25951
基因别名 JHDM1D; KIAA1718

基因功能与研究简介

KDM7A(lysine demethylase 7A)编码一种含有JmjC结构域的组蛋白去甲基化酶,能够特异性去除组蛋白H3第9位赖氨酸的二甲基化(H3K9me2)和组蛋白H3第27位赖氨酸的二甲基化(H3K27me2),从而调控基因转录。KDM7A在神经发育、细胞增殖和分化中发挥重要作用,其异常表达与多种疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神发育迟滞 KDM7A突变可能导致神经发育异常,影响认知功能。 暂无明确证据
癌症 KDM7A在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控基因表达影响肿瘤发生发展。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Pro189LeufsTer5) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致KDM7A蛋白活性降低或丧失,可能影响组蛋白去甲基化,进而导致基因表达异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:目前暂无明确证据表明KDM7A存在功能获得突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明KDM7A存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0032453 demethylase activity • GO:0005634 nucleus
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated

相关通路

Epigenetic regulation of gene expression
Histone modification

蛋白质功能简介

KDM7A蛋白属于JmjC结构域家族,包含JmjC结构域和PHD锌指结构域。它能够去除组蛋白H3K9me2和H3K27me2,从而激活基因转录。KDM7A在神经发育中至关重要,其突变可能导致神经发育障碍。此外,KDM7A在多种癌症中表达异常,可能作为潜在的治疗靶点。

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