KDM8基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
KDM8是一种组蛋白去甲基化酶,参与基因转录调控、细胞周期和肿瘤发生,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | KDM8 |
|---|---|
| 基因全名 | lysine demethylase 8 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p12.1 |
| NCBI Gene ID | 79831 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79831 |
| Ensembl ID | ENSG00000103510 |
| UniProt ID | Q8N371 |
| OMIM ID | 611914 |
| HGNC ID | 26005 |
| 基因别名 | JMJD5, FLJ13798 |
基因功能与研究简介
KDM8(lysine demethylase 8)编码一种含有JmjC结构域的组蛋白去甲基化酶,能够特异性去除组蛋白H3赖氨酸36的二甲基化修饰(H3K36me2),从而调控基因转录。KDM8参与细胞周期调控、DNA损伤修复和代谢等过程,其异常表达与多种癌症的发生发展密切相关。研究表明,KDM8在多种肿瘤中高表达,并促进肿瘤细胞增殖和迁移,因此成为潜在的癌症治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | KDM8在乳腺癌中高表达,通过去甲基化H3K36me2促进癌基因表达,增强细胞增殖和侵袭能力。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | KDM8在非小细胞肺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | KDM8在肝癌组织中高表达,促进肿瘤生长和转移,可能通过激活Wnt/β-catenin信号通路。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | KDM8在结直肠癌中表达升高,与肿瘤分期和淋巴结转移相关,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)促进侵袭。 | 较强研究证据 |
| 肾细胞癌 | KDM8在肾癌中表达异常,可能参与缺氧诱导的肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1045C>T (p.Arg349Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或酶活性,但功能影响尚未明确 |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能改变底物结合,但缺乏功能验证 |
| c.1567G>A (p.Val523Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,但临床意义未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
KDM8功能缺失突变可能导致H3K36me2水平升高,影响基因表达调控,但目前在癌症中尚未明确鉴定出KDM8的失活突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
KDM8在多种癌症中高表达,可能通过增强去甲基化酶活性促进肿瘤发生,属于功能获得性改变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明KDM8存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0032453 demethylase activity | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006355 regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0007049 cell cycle | • GO:0006281 DNA repair |
相关通路
• hsa04110 Cell cycle
• hsa05200 Pathways in cancer
• hsa04310 Wnt signaling pathway
蛋白质功能简介
KDM8蛋白由约500个氨基酸组成,含有JmjC结构域,属于Jumonji家族去甲基化酶。它能够特异性去除组蛋白H3赖氨酸36的二甲基化修饰(H3K36me2),从而激活基因转录。KDM8在细胞核中表达,参与调控细胞周期相关基因的表达,影响细胞增殖和分化。此外,KDM8还参与DNA损伤修复和代谢调控,其异常表达与多种癌症的恶性进展相关。