KHDC3L基因|基因功能、疾病关联、突变与生殖研究

KHDC3L是母源效应基因,其突变与双亲源性完全性葡萄胎(BiCHM)相关,在基因组印记和早期胚胎发育中发挥关键作用。

基因信息卡

基因符号 KHDC3L
基因全名 KH domain containing 3-like
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q13
NCBI Gene ID 154288 ncbi.nlm.nih.gov/gene/154288
Ensembl ID ENSG00000181031
UniProt ID Q6ZP98
OMIM ID 617705
HGNC ID 28236
基因别名 C6orf123, dJ1033B1.2

基因功能与研究简介

KHDC3L(KH domain containing 3-like)基因位于人类染色体6q13,编码一种含有KH结构域的蛋白。该蛋白属于母源效应因子,在卵母细胞中高表达,对早期胚胎发育和基因组印记的建立至关重要。KHDC3L突变可导致双亲源性完全性葡萄胎(BiCHM),这是一种罕见的妊娠相关疾病,表现为胚胎发育异常和滋养细胞过度增生。KHDC3L通过与NLRP7等蛋白相互作用,参与调控母源基因的印记和胚胎发育。目前,KHDC3L的功能研究主要集中于其在生殖和印记中的作用,其具体分子机制仍在深入探索中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
双亲源性完全性葡萄胎(BiCHM) KHDC3L基因突变导致母源印记建立失败,引起双亲源性完全性葡萄胎。该病表现为胚胎发育停滞,滋养细胞过度增生,具有潜在恶性风险。 已明确致病(OMIM 617705)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
卵巢 暂无可靠数据 KHDC3L在卵母细胞中高表达,但nTPM数据暂无
睾丸 暂无可靠数据 暂无明确证据
胎盘 暂无可靠数据 暂无明确证据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
人胚胎干细胞(hESC) 暂无可靠数据 暂无明确证据
人卵母细胞 暂无可靠数据 KHDC3L在卵母细胞中高表达,但nTPM数据暂无
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白翻译起始失败,功能丧失
c.226C>T (p.Arg76*) 无义突变 罕见 Loss of Function,产生截短蛋白,功能丧失
c.365_366del (p.Glu122Glyfs*13) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):KHDC3L突变导致蛋白功能丧失,无法正常参与母源印记建立,是BiCHM的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明KHDC3L存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负效):目前暂无明确证据表明KHDC3L突变具有显性负效作用。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0003676 nucleic acid binding

相关通路

暂无明确通路数据

蛋白质功能简介

KHDC3L蛋白含有KH结构域,该结构域通常参与RNA结合,提示KHDC3L可能通过结合RNA调控母源基因的表达。KHDC3L与NLRP7相互作用,参与母源印记的建立。在卵母细胞中,KHDC3L可能通过调控特定基因的甲基化状态,影响胚胎发育。目前,KHDC3L的底物和具体分子机制尚不完全清楚,但已有研究表明其功能丧失与BiCHM密切相关。

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