KHDRBS3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KHDRBS3编码RNA结合蛋白,参与RNA加工和基因表达调控,与多种癌症和神经发育相关。

基因信息卡

基因符号 KHDRBS3
基因全名 KHDRBS3 (KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3)
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 8q24.2
NCBI Gene ID 10656 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10656
Ensembl ID ENSG00000104738
UniProt ID Q9Y5K6
OMIM ID 610311
HGNC ID 18172
基因别名 Salpalpha, SLM-2, Etle-1

基因功能与研究简介

KHDRBS3(KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3)编码一种RNA结合蛋白,属于KHDRBS家族。该蛋白含有KH结构域和STAR(signal transduction and activation of RNA)结构域,参与RNA加工、剪接、运输和翻译调控。KHDRBS3在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,KHDRBS3在细胞增殖、分化和凋亡中发挥作用,并与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经发育疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 KHDRBS3表达异常与乳腺癌的发生发展相关,可能通过调控RNA剪接影响肿瘤相关基因表达。 较强研究证据
肺癌 KHDRBS3在肺癌组织中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖和迁移。 较强研究证据
神经发育障碍 KHDRBS3在脑组织中高表达,可能参与神经元分化,其突变或表达异常与神经发育障碍相关。 潜在关联
结直肠癌 KHDRBS3表达水平与结直肠癌的预后相关,可能作为潜在生物标志物。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
乳腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 (乳腺癌细胞系) 暂无可靠数据 表达
A549 (肺癌细胞系) 暂无可靠数据 表达
HEK293 (胚胎肾细胞系) 暂无可靠数据 表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456C>T (p.Pro152Leu) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合能力
c.789delC (p.Arg264ValfsTer12) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致蛋白功能丧失或减弱,如移码突变导致的截短蛋白。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:增强蛋白活性或产生新功能,目前KHDRBS3尚无明确的功能获得突变报道。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常蛋白功能,目前KHDRBS3尚无明确的显性负性突变报道。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0006397 (mRNA processing)
• GO:0008380 (RNA splicing)

相关通路

Pathway: hsa03040 (Spliceosome)
Pathway: hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

KHDRBS3蛋白属于STAR家族,包含KH结构域和QUA1/QUA2结构域,能够结合RNA并参与mRNA的剪接、运输和翻译调控。该蛋白在细胞核和细胞质中均有分布,通过与多种RNA和蛋白相互作用,调节基因表达。KHDRBS3在脑和睾丸中高表达,提示其在神经发育和生殖细胞功能中具有重要作用。

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