KLF17基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KLF17(Krüppel样因子17)是一种转录因子,在胚胎发育和肿瘤抑制中发挥重要作用,其表达下调与多种癌症的进展和不良预后相关。

基因信息卡

基因符号 KLF17
基因全名 Krüppel-like factor 17
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p34.1
NCBI Gene ID 57585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57585
Ensembl ID ENSG00000116285
UniProt ID Q5JT82
OMIM ID 609393
HGNC ID 19688
基因别名 Zfp393, ZNF393

基因功能与研究简介

KLF17(Krüppel样因子17)属于Krüppel样因子(KLF)家族,是一种含有锌指结构的转录因子。KLF17在胚胎发育中发挥关键作用,特别是在中胚层形成和神经管发育中。在成体中,KLF17在多种组织中表达,但水平较低。研究表明,KLF17在多种癌症中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子,通过调控上皮-间充质转化(EMT)和细胞增殖等过程抑制肿瘤进展。此外,KLF17还参与调控细胞分化、凋亡和干细胞特性维持。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 KLF17表达下调与肝细胞癌的侵袭和转移相关,可能通过调控EMT促进肿瘤进展。 较强研究证据
乳腺癌 KLF17在乳腺癌中表达降低,与不良预后相关,可能通过抑制EMT和细胞迁移发挥作用。 较强研究证据
胃癌 KLF17表达下调与胃癌的恶性程度和淋巴结转移相关,可能作为预后标志物。 潜在关联
结直肠癌 KLF17在结直肠癌中表达下调,可能通过调控Wnt信号通路影响肿瘤发生。 潜在关联
肺癌 KLF17表达降低与非小细胞肺癌的侵袭性相关,可能作为肿瘤抑制因子。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 (乳腺癌细胞系) 暂无可靠数据 KLF17表达较低
HepG2 (肝癌细胞系) 暂无可靠数据 KLF17表达较低
A549 (肺癌细胞系) 暂无可靠数据 KLF17表达较低
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明确
c.456delA (p.Lys152fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致KLF17蛋白表达减少或功能缺失,可能促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明KLF17存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明KLF17存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0007275 (multicellular organism development) • GO:0010628 (positive regulation of gene expression)
• GO:0030154 (cell differentiation) • GO:0045893 (positive regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:2000272 (negative regulation of signaling pathway)

相关通路

Epithelial to mesenchymal transition (EMT) pathway
TGF-beta signaling pathway
Wnt signaling pathway

蛋白质功能简介

KLF17蛋白由393个氨基酸组成,包含三个C2H2型锌指结构域,定位于细胞核。作为转录因子,KLF17通过结合DNA调控下游基因表达。在胚胎发育中,KLF17对于中胚层形成至关重要。在成体中,KLF17在多种组织中低表达,但在癌症中常下调。KLF17通过抑制EMT、调控细胞周期和凋亡等机制发挥肿瘤抑制作用。此外,KLF17还参与调控干细胞多能性和分化。

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