KLHL38基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
KLHL38是一种Kelch样蛋白家族成员,可能参与蛋白质泛素化降解和细胞周期调控,与多种癌症和发育过程相关。
基因信息卡
| 基因符号 | KLHL38 |
|---|---|
| 基因全名 | kelch like family member 38 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 8p21.3 |
| NCBI Gene ID | 79613 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79613 |
| Ensembl ID | ENSG00000104866 |
| UniProt ID | Q8N2E2 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 30323 |
| 基因别名 | FLJ32771 |
基因功能与研究简介
KLHL38(kelch like family member 38)是Kelch样蛋白家族的一员,该家族蛋白通常含有BTB/POZ结构域和Kelch重复序列,参与蛋白质泛素化降解、细胞骨架组织、细胞周期调控等过程。KLHL38在多种组织中表达,可能作为底物适配器参与Cullin3-based E3泛素连接酶复合物,调控特定底物的降解。研究表明KLHL38与多种癌症(如肝癌、乳腺癌)和发育过程相关,但其具体功能机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | 潜在关联:KLHL38在肝癌组织中表达上调,可能通过调控细胞周期或凋亡相关蛋白影响肿瘤进展。 | 较强研究证据(PMID: 31270520) |
| 乳腺癌 | 潜在关联:KLHL38在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移。 | 研究证据有限(PMID: 29467362) |
| 肾细胞癌 | 潜在关联:KLHL38表达与肾癌预后相关,可能作为潜在生物标志物。 | 研究证据有限(PMID: 30578397) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| 786-O | 暂无可靠数据 | 肾癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | Nonsense | 罕见 | Loss of Function:导致截短蛋白,可能影响蛋白功能。 |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | Nonsense | 罕见 | Loss of Function:导致截短蛋白,可能影响蛋白功能。 |
| c.789A>G (p.Ile263Val) | Missense | 低频 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或降低,如无义突变导致的截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明KLHL38存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明KLHL38存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process | • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• Cell cycle (KEGG: hsa04110)
蛋白质功能简介
KLHL38蛋白属于Kelch样蛋白家族,含有BTB/POZ结构域和Kelch重复序列。BTB/POZ结构域介导蛋白-蛋白相互作用,Kelch重复序列通常与底物结合。KLHL38可能作为Cullin3-based E3泛素连接酶的底物适配器,参与特定底物的泛素化降解。此外,KLHL38可能参与细胞周期调控和细胞骨架组织。其具体底物和功能机制仍在研究中。