KLHL6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KLHL6是BTB-Kelch家族成员,参与B细胞受体信号调控,与B细胞淋巴瘤发生密切相关。

基因信息卡

基因符号 KLHL6
基因全名 kelch-like family member 6
基因类型 protein-coding gene
染色体位置 3q27.3
NCBI Gene ID 89857 ncbi.nlm.nih.gov/gene/89857
Ensembl ID ENSG00000172531
UniProt ID Q8WZ60
OMIM ID 612067
HGNC ID 18657
基因别名 FLJ20032

基因功能与研究简介

KLHL6(kelch-like family member 6)是BTB-Kelch蛋白家族的成员,该家族蛋白通常作为Cullin3 E3泛素连接酶的底物识别亚基,参与蛋白质泛素化降解。KLHL6在B细胞中高表达,参与B细胞受体(BCR)信号通路的调控,影响B细胞的发育和功能。研究表明,KLHL6的突变与B细胞淋巴瘤(如弥漫大B细胞淋巴瘤)的发生相关,可能通过影响BCR信号传导和细胞增殖促进肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
弥漫大B细胞淋巴瘤 KLHL6突变导致BCR信号通路异常激活,促进B细胞增殖和存活,与肿瘤发生相关。 较强研究证据
滤泡性淋巴瘤 KLHL6突变在滤泡性淋巴瘤中也有报道,可能参与疾病进展。 潜在关联
B细胞慢性淋巴细胞白血病 部分研究提示KLHL6突变可能与该疾病相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 KLHL6在脾脏中表达较高,但具体nTPM值暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 KLHL6在淋巴结中表达,但具体nTPM值暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 KLHL6在B细胞中表达,但具体nTPM值暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Ramos 暂无可靠数据 Burkitt淋巴瘤细胞系,KLHL6表达较高
Daudi 暂无可靠数据 Burkitt淋巴瘤细胞系,KLHL6表达较高
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系,KLHL6表达较低
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1138C>T (p.Arg380Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.1246G>A (p.Gly416Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与淋巴瘤相关
c.1570C>T (p.Arg524Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与淋巴瘤相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

部分KLHL6突变可能导致蛋白功能丧失,影响BCR信号通路的正常调控,从而促进B细胞异常增殖。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明KLHL6突变具有功能获得性。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明KLHL6突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005829 cytosol • GO:0005634 nucleus
• GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding

相关通路

B cell receptor signaling pathway (Reactome: R-HSA-983705)
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers (Reactome: R-HSA-983695)

蛋白质功能简介

KLHL6蛋白属于BTB-Kelch家族,包含BTB/POZ结构域和Kelch重复序列。BTB结构域介导与Cullin3的相互作用,形成E3泛素连接酶复合物,而Kelch重复序列负责底物识别。KLHL6在B细胞中高表达,参与BCR信号通路的调控,可能通过泛素化降解特定底物来调节B细胞的增殖和分化。其突变可能导致蛋白功能异常,进而影响BCR信号传导,促进B细胞淋巴瘤的发生。

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