KMT2D基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KMT2D是组蛋白甲基转移酶,参与基因表达调控,其突变与Kabuki综合征及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 KMT2D
基因全名 lysine methyltransferase 2D
基因类型 protein coding
染色体位置 12q13.12
NCBI Gene ID 8085 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8085
Ensembl ID ENSG00000167548
UniProt ID O14686
OMIM ID 602113
HGNC ID 7133
基因别名 MLL2, ALR, CAGL114, KABUK1, TNRC21

基因功能与研究简介

KMT2D(赖氨酸甲基转移酶2D)基因编码组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基转移酶,是COMPASS复合物的成员,通过催化H3K4甲基化参与基因转录激活。KMT2D在胚胎发育、细胞分化和肿瘤抑制中发挥重要作用。KMT2D突变可导致Kabuki综合征(一种多系统发育异常疾病),并在多种癌症中频繁发生体细胞突变,提示其作为肿瘤抑制基因的角色。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Kabuki综合征 KMT2D功能缺失突变导致H3K4甲基化异常,影响基因表达,导致多器官发育异常。 已明确致病
多发性骨髓瘤 KMT2D体细胞突变可能通过影响基因表达调控促进肿瘤发生。 癌症相关
胃癌 KMT2D突变在胃癌中频繁发生,可能通过失活肿瘤抑制功能促进肿瘤进展。 癌症相关
弥漫性大B细胞淋巴瘤 KMT2D突变常见于生发中心B细胞型,可能影响B细胞分化。 癌症相关
非小细胞肺癌 KMT2D突变与肺癌发生相关,可能通过表观遗传失调促进肿瘤。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.12345delC (p.Arg4115fs) 移码突变 暂无可靠数据 Loss of Function
c.6789G>A (p.Trp2263*) 无义突变 暂无可靠数据 Loss of Function
c.4567C>T (p.Arg1523*) 无义突变 暂无可靠数据 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致KMT2D蛋白失活或截短,丧失甲基转移酶活性,影响H3K4甲基化,导致基因表达异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据:目前未发现KMT2D的功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据:KMT2D突变通常为单倍剂量不足或功能缺失,显性负效应证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008270 (zinc ion binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0018024 (histone H3K4 methyltransferase activity) • GO:0006351 (transcription
• DNA-templated) • GO:0005654 (nucleoplasm)
• GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
hsa05203 (Viral carcinogenesis)
hsa05205 (Proteoglycans in cancer)
hsa05206 (MicroRNAs in cancer)

蛋白质功能简介

KMT2D蛋白是组蛋白H3K4甲基转移酶,属于COMPASS复合物,通过催化H3K4me1/2/3修饰激活基因转录。KMT2D在发育和分化中起关键作用,其突变导致Kabuki综合征,并在多种癌症中作为肿瘤抑制因子失活。

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