KMT5C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

KMT5C(SUV420H2)是组蛋白赖氨酸甲基转移酶,负责H4K20me2/3修饰,参与DNA损伤修复、细胞周期调控和基因组稳定性维持。

基因信息卡

基因符号 KMT5C
基因全名 lysine methyltransferase 5C
基因类型 protein coding
染色体位置 19q13.43
NCBI Gene ID 196483 ncbi.nlm.nih.gov/gene/196483
Ensembl ID ENSG00000105610
UniProt ID Q86Y97
OMIM ID 617811
HGNC ID 29401
基因别名 SUV420H2, dJ726C3.5

基因功能与研究简介

KMT5C(lysine methyltransferase 5C)编码组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,属于SET家族,特异性催化组蛋白H4第20位赖氨酸的二甲基化和三甲基化(H4K20me2和H4K20me3)。该酶在DNA损伤应答、细胞周期调控、染色质结构和基因组稳定性中发挥关键作用。KMT5C通过其甲基转移酶活性参与DNA双链断裂修复,特别是非同源末端连接(NHEJ)途径。此外,KMT5C还参与有丝分裂纺锤体检查点调控和细胞衰老过程。研究表明,KMT5C表达异常与多种癌症相关,但其在肿瘤发生中的具体作用尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 KMT5C表达异常与多种癌症相关,可能通过影响DNA损伤修复和基因组稳定性促进肿瘤发生。 研究证据:多项研究表明KMT5C在多种肿瘤中表达上调或下调,但具体机制尚不明确。
免疫缺陷 暂无明确证据 暂无可靠数据
神经系统疾病 暂无明确证据 暂无可靠数据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响酶活性,但需功能验证
c.567del (p.Gly190ValfsTer23) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致KMT5C蛋白表达缺失或酶活性降低,影响H4K20me2/3修饰,进而影响DNA损伤修复和基因组稳定性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明KMT5C存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明KMT5C存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005654 nucleoplasm • GO:0005829 cytosol
• GO:0008170 N-methyltransferase activity • GO:0018024 histone-lysine N-methyltransferase activity
• GO:0035097 histone methyltransferase activity (H4-K20 specific) • GO:0042802 identical protein binding
• GO:0046982 protein heterodimerization activity • GO:0006325 chromatin organization
• GO:0006334 nucleosome assembly • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus
• GO:0007049 cell cycle • GO:0008283 cell proliferation
• GO:0016568 chromatin modification • GO:0031571 mitotic G1 DNA damage checkpoint
• GO:0031572 mitotic G2 DNA damage checkpoint • GO:0032206 positive regulation of telomere maintenance
• GO:0045814 negative regulation of gene expression • epigenetic
• GO:0051726 regulation of cell cycle • GO:0071158 positive regulation of cell cycle arrest
• GO:1901796 regulation of signal transduction by p53 class mediator

相关通路

DNA Damage Response (Homo sapiens)
Cellular Senescence (Homo sapiens)
Cell Cycle
Mitotic (Homo sapiens)
Chromatin organization (Homo sapiens)

蛋白质功能简介

KMT5C蛋白(UniProt Q86Y97)属于SET家族,含有SET结构域和C端结构域,分子量约52 kDa。该蛋白主要定位于细胞核,在染色质上催化H4K20me2和H4K20me3的生成。KMT5C在DNA损伤应答中通过促进53BP1的招募参与NHEJ修复,并在细胞周期检查点调控中发挥作用。此外,KMT5C还参与端粒维持和基因表达调控。其表达水平在细胞周期中受到调控,在G2/M期达到高峰。

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