L2HGDH基因|功能、疾病关联、突变与代谢研究
L2HGDH编码L-2-羟基戊二酸脱氢酶,其缺陷导致L-2-羟基戊二酸尿症,并参与多种代谢与肿瘤相关过程。
基因信息卡
| 基因符号 | L2HGDH |
|---|---|
| 基因全名 | L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q21.3 |
| NCBI Gene ID | 79944 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79944 |
| Ensembl ID | ENSG00000100823 |
| UniProt ID | Q9H9P8 |
| OMIM ID | 609584 |
| HGNC ID | 18711 |
| 基因别名 | C14orf160, DKFZp686B16102 |
基因功能与研究简介
L2HGDH基因编码L-2-羟基戊二酸脱氢酶,该酶位于线粒体,催化L-2-羟基戊二酸(L-2-HG)氧化为α-酮戊二酸(α-KG)。L-2-HG是一种潜在的致癌代谢物,其积累可抑制α-KG依赖性双加氧酶,影响表观遗传调控和细胞分化。L2HGDH功能缺失导致L-2-羟基戊二酸尿症,一种常染色体隐性遗传的神经代谢性疾病。此外,L2HGDH表达异常与多种肿瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| L-2-羟基戊二酸尿症 | L2HGDH基因突变导致酶活性丧失,L-2-HG在体内积累,引起神经毒性,表现为发育迟缓、癫痫、肌张力障碍等。 | 已明确致病 |
| 多种肿瘤 | L2HGDH表达下调或突变导致L-2-HG积累,抑制α-KG依赖性双加氧酶,影响DNA和组蛋白去甲基化,促进肿瘤发生。 | 具有较强研究证据 |
| 胶质瘤 | IDH1/2突变导致2-HG产生,但L2HGDH表达降低也可能导致L-2-HG积累,参与胶质瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.905G>A (p.Arg302His) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 导致酶活性降低或丧失 |
| c.1130C>T (p.Pro377Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 导致酶活性降低或丧失 |
| c.1298delA (p.Glu433Glyfs*23) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 导致蛋白质截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
L2HGDH突变导致酶活性丧失或降低,无法正常氧化L-2-HG,导致L-2-HG积累。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明L2HGDH存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明L2HGDH突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003824 (catalytic activity) | • GO:0005739 (mitochondrion) |
| • GO:0008941 (L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase activity) | • GO:0055114 (oxidation-reduction process) |
相关通路
• 2-hydroxyglutarate metabolism
• lysine degradation
蛋白质功能简介
L2HGDH蛋白由约520个氨基酸组成,定位于线粒体基质。它属于FAD依赖性氧化还原酶家族,催化L-2-HG氧化为α-KG。该酶对维持细胞内α-KG和L-2-HG的平衡至关重要。L2HGDH缺陷导致L-2-HG积累,影响多种α-KG依赖性双加氧酶,包括TET酶和JmjC组蛋白去甲基化酶,从而改变表观遗传状态。