LARGE1基因|基因功能、疾病关联、突变与糖基化研究
LARGE1编码糖基转移酶,参与α-肌营养不良蛋白聚糖的糖基化,其突变导致肌营养不良症。
基因信息卡
| 基因符号 | LARGE1 |
|---|---|
| 基因全名 | LARGE xylosyl- and glucuronyltransferase 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 22q12.3 |
| NCBI Gene ID | 9215 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9215 |
| Ensembl ID | ENSG00000100106 |
| UniProt ID | O95427 |
| OMIM ID | 603590 |
| HGNC ID | 6511 |
| 基因别名 | LARGE, MDC1D, DKFZp686L20237 |
基因功能与研究简介
LARGE1基因编码一种糖基转移酶,属于糖基转移酶家族。该酶参与α-肌营养不良蛋白聚糖(α-dystroglycan)的O-甘露糖糖基化修饰,对维持细胞外基质与细胞骨架的连接至关重要。LARGE1突变可导致α-肌营养不良蛋白聚糖糖基化缺陷,进而引发肌营养不良症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性肌营养不良症1D型 | LARGE1基因突变导致α-肌营养不良蛋白聚糖糖基化异常,影响基底膜与肌纤维的稳定性,导致肌营养不良。 | 已明确致病 |
| 肌营养不良-糖基化异常伴癫痫和智力障碍 | LARGE1突变导致α-肌营养不良蛋白聚糖糖基化缺陷,影响神经元迁移和突触功能,导致神经系统异常。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | LARGE1在多种肿瘤中表达异常,可能影响肿瘤细胞与基质的相互作用,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 人骨骼肌成肌细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 人胚胎肾细胞293T | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 人神经母细胞瘤细胞SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.331C>T (p.Arg111*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1381dupA (p.Thr461Asnfs*5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2002C>T (p.Arg668Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致LARGE1蛋白活性降低或丧失,影响α-肌营养不良蛋白聚糖的糖基化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明LARGE1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LARGE1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008375 (乙酰葡萄糖胺基转移酶活性) | • GO:0016757 (糖基转移酶活性) |
| • GO:0005794 (高尔基体) | • GO:0000139 (高尔基膜) |
| • GO:0006486 (蛋白糖基化) | • GO:0007160 (细胞基质黏附) |
相关通路
• hsa00512 (O-甘露糖聚糖生物合成)
• hsa04510 (黏着斑)
• hsa04512 (ECM-受体相互作用)
蛋白质功能简介
LARGE1蛋白是一种双功能糖基转移酶,具有木糖基转移酶和葡萄糖醛酸基转移酶活性,参与α-肌营养不良蛋白聚糖的O-甘露糖糖基化修饰。该蛋白定位于高尔基体,通过修饰α-肌营养不良蛋白聚糖,维持细胞外基质与细胞骨架的连接。LARGE1突变导致α-肌营养不良蛋白聚糖糖基化缺陷,进而引发肌营养不良症。