LARP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LARP1是RNA结合蛋白,调控mRNA翻译与稳定性,与多种癌症和代谢疾病相关。

基因信息卡

基因符号 LARP1
基因全名 La ribonucleoprotein 1, translational regulator
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q33.2
NCBI Gene ID 23367 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23367
Ensembl ID ENSG00000155506
UniProt ID Q6PKG0
OMIM ID 610290
HGNC ID 29547
基因别名 LARP, PP7712, MGC117267

基因功能与研究简介

LARP1(La ribonucleoprotein 1, translational regulator)是一种RNA结合蛋白,属于LARP家族。它通过结合mRNA的5'端寡嘧啶序列(5'TOP)调控核糖体蛋白和翻译相关因子的翻译,从而影响细胞生长和增殖。LARP1还参与mRNA的稳定性调控和应激颗粒的形成。研究表明,LARP1在多种癌症中高表达,并与肿瘤进展和不良预后相关。此外,LARP1可能参与代谢调控和神经系统功能。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 LARP1高表达促进肿瘤细胞增殖和转移,可能通过调控mTOR通路相关mRNA的翻译。 较强研究证据
结直肠癌 LARP1表达上调与肿瘤分期和预后不良相关,可能通过影响细胞周期和凋亡相关基因的翻译。 较强研究证据
肺癌 LARP1在非小细胞肺癌中高表达,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)相关基因促进侵袭。 研究证据
乳腺癌 LARP1表达与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过调控雌激素受体信号通路。 研究证据
2型糖尿病 LARP1可能通过调控胰岛素受体底物(IRS)的翻译影响胰岛素信号通路,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响RNA结合能力,导致功能改变
c.567C>T (p.Arg189Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性或相互作用
c.890_891insA (p.Leu297Thrfs*13) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致LARP1蛋白表达减少或功能缺失,影响mRNA翻译调控,进而影响细胞增殖和代谢。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强LARP1的RNA结合或翻译调控能力,促进肿瘤发生发展。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常LARP1功能,影响其与mRNA或其他蛋白的相互作用。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA binding (GO:0003723) • mRNA binding (GO:0003729)
• regulation of translation (GO:0006417) • cytoplasmic stress granule (GO:0010494)
• P-body (GO:0000932)

相关通路

mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04150)
Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

LARP1蛋白包含一个La模块和一个RNA识别基序(RRM),能够结合mRNA的5'TOP序列。它通过与PABP和eIF4F复合物相互作用调控翻译起始,并在应激条件下参与应激颗粒的形成。LARP1还参与调控mRNA的稳定性,影响细胞周期、增殖和凋亡相关基因的表达。

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