LARP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LARP1是RNA结合蛋白,调控mRNA翻译与稳定性,与多种癌症和代谢疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LARP1 |
|---|---|
| 基因全名 | La ribonucleoprotein 1, translational regulator |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q33.2 |
| NCBI Gene ID | 23367 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23367 |
| Ensembl ID | ENSG00000155506 |
| UniProt ID | Q6PKG0 |
| OMIM ID | 610290 |
| HGNC ID | 29547 |
| 基因别名 | LARP, PP7712, MGC117267 |
基因功能与研究简介
LARP1(La ribonucleoprotein 1, translational regulator)是一种RNA结合蛋白,属于LARP家族。它通过结合mRNA的5'端寡嘧啶序列(5'TOP)调控核糖体蛋白和翻译相关因子的翻译,从而影响细胞生长和增殖。LARP1还参与mRNA的稳定性调控和应激颗粒的形成。研究表明,LARP1在多种癌症中高表达,并与肿瘤进展和不良预后相关。此外,LARP1可能参与代谢调控和神经系统功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | LARP1高表达促进肿瘤细胞增殖和转移,可能通过调控mTOR通路相关mRNA的翻译。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | LARP1表达上调与肿瘤分期和预后不良相关,可能通过影响细胞周期和凋亡相关基因的翻译。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | LARP1在非小细胞肺癌中高表达,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)相关基因促进侵袭。 | 研究证据 |
| 乳腺癌 | LARP1表达与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过调控雌激素受体信号通路。 | 研究证据 |
| 2型糖尿病 | LARP1可能通过调控胰岛素受体底物(IRS)的翻译影响胰岛素信号通路,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响RNA结合能力,导致功能改变 |
| c.567C>T (p.Arg189Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
| c.890_891insA (p.Leu297Thrfs*13) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变可能导致LARP1蛋白表达减少或功能缺失,影响mRNA翻译调控,进而影响细胞增殖和代谢。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变可能增强LARP1的RNA结合或翻译调控能力,促进肿瘤发生发展。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰正常LARP1功能,影响其与mRNA或其他蛋白的相互作用。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • RNA binding (GO:0003723) | • mRNA binding (GO:0003729) |
| • regulation of translation (GO:0006417) | • cytoplasmic stress granule (GO:0010494) |
| • P-body (GO:0000932) |
相关通路
• mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04150)
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
蛋白质功能简介
LARP1蛋白包含一个La模块和一个RNA识别基序(RRM),能够结合mRNA的5'TOP序列。它通过与PABP和eIF4F复合物相互作用调控翻译起始,并在应激条件下参与应激颗粒的形成。LARP1还参与调控mRNA的稳定性,影响细胞周期、增殖和凋亡相关基因的表达。
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