LARP7基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LARP7是7SK核糖核蛋白复合物的关键组分,通过调控P-TEFb活性影响转录延伸,其功能缺失与多种癌症及智力障碍相关。

基因信息卡

基因符号 LARP7
基因全名 La ribonucleoprotein 7, transcriptional regulator
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q25
NCBI Gene ID 51574 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51574
Ensembl ID ENSG00000174720
UniProt ID Q4G0J3
OMIM ID 612869
HGNC ID 24921
基因别名 DKFZp686H1720; FLJ12529; LARP7; MGC138234; MGC141933

基因功能与研究简介

LARP7(La核糖核蛋白7,转录调控因子)是7SK核糖核蛋白复合物(7SK snRNP)的核心组分,该复合物通过结合并抑制正性转录延伸因子b(P-TEFb)的活性,从而调控RNA聚合酶II的转录延伸。LARP7包含一个La模块和一个RRM结构域,负责结合7SK RNA并维持其稳定性。LARP7功能缺失导致P-TEFb过度激活,进而引起基因表达异常,与多种疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
智力障碍-心脏缺陷-面部畸形综合征(Alazami syndrome) LARP7纯合或复合杂合突变导致功能缺失,影响7SK snRNP复合物稳定性,导致P-TEFb活性失调,影响神经发育和心脏形成。 OMIM收录,ClinVar有致病性记录
多种癌症(如乳腺癌、肺癌、胃癌等) LARP7在多种肿瘤中表达下调或突变,导致P-TEFb活性升高,促进细胞增殖和转移。 COSMIC数据库记录体细胞突变,多项研究报道(PMID: 25631445等)
子宫内膜癌 LARP7突变或表达异常与子宫内膜癌的发生发展相关。 COSMIC数据库记录,研究证据(PMID: 26555599)
潜在关联:自身免疫性疾病 LARP7可能通过调控免疫相关基因表达参与自身免疫,但证据尚不充分。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾上腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.676C>T (p.Arg226*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能缺失
c.1183C>T (p.Arg395*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能缺失
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 Loss of Function,影响翻译起始
c.IVS2+1G>A 剪接位点突变 罕见 Loss of Function,导致剪接异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LARP7突变导致蛋白功能缺失,影响7SK snRNP复合物稳定性,导致P-TEFb活性异常升高。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LARP7存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LARP7突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006366 transcription by RNA polymerase II
• GO:0030515 snoRNA binding

相关通路

7SK snRNP complex pathway (Reactome: R-HSA-6814756)
P-TEFb regulation pathway (Reactome: R-HSA-6814755)

蛋白质功能简介

LARP7蛋白包含一个La模块和一个RRM结构域,定位于细胞核。它作为7SK snRNP复合物的核心组分,通过结合7SK RNA维持其稳定性,并招募P-TEFb,抑制其激酶活性,从而调控RNA聚合酶II的转录延伸。LARP7功能缺失导致P-TEFb过度激活,影响基因表达程序,与多种疾病相关。

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