LCA5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LCA5基因编码纤毛蛋白,其突变是Leber先天性黑矇(LCA)的致病原因之一,在视网膜感光细胞功能维持中发挥关键作用。

基因信息卡

基因符号 LCA5
基因全名 Leber congenital amaurosis 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q14.1
NCBI Gene ID 167691 ncbi.nlm.nih.gov/gene/167691
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q86VQ0
OMIM ID 611408
HGNC ID 19923
基因别名 LCA5L, C6orf152

基因功能与研究简介

LCA5基因编码纤毛蛋白,该蛋白定位于感光细胞连接纤毛,参与蛋白质运输和纤毛功能维持。LCA5基因突变是Leber先天性黑矇(LCA)的致病原因之一,LCA是一种严重的遗传性视网膜营养不良,通常在婴儿期发病,导致严重视力障碍或失明。LCA5突变多为功能缺失型,导致纤毛功能障碍,进而影响感光细胞存活。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Leber先天性黑矇(Leber congenital amaurosis) LCA5基因突变导致功能缺失,影响感光细胞纤毛功能,导致视网膜变性。 已明确致病
视网膜色素变性(Retinitis pigmentosa) 部分LCA5突变可能与非典型视网膜色素变性相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
Y79 暂无可靠数据 视网膜母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.835_836del (p.Leu279GlufsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1174C>T (p.Arg392Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1543C>T (p.Arg515Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LCA5突变多为功能缺失型,导致蛋白截短或降解,影响纤毛功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005929 (cilium)
• GO:0060271 (cilium assembly) • GO:0007601 (visual perception)

相关通路

Cilium assembly (GO:0060271)
Phototransduction (KEGG: hsa04744)

蛋白质功能简介

LCA5蛋白(UniProt Q86VQ0)由599个氨基酸组成,含有卷曲螺旋结构域,定位于感光细胞连接纤毛。该蛋白参与纤毛内蛋白质运输,对维持感光细胞功能至关重要。LCA5突变导致蛋白功能丧失,引起纤毛功能障碍,最终导致感光细胞死亡。

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