LCE1A基因|表皮分化相关蛋白、皮肤屏障功能与皮肤病研究

LCE1A是表皮晚期分化复合体成员,参与皮肤屏障形成,与银屑病等皮肤病相关。

基因信息卡

基因符号 LCE1A
基因全名 Late Cornified Envelope 1A
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q21.3
NCBI Gene ID 353135 ncbi.nlm.nih.gov/gene/353135
Ensembl ID ENSG00000172156
UniProt ID Q5T7P2
OMIM ID 612605
HGNC ID 29462
基因别名 LEP1, LEP1A, SPRL1A

基因功能与研究简介

LCE1A(Late Cornified Envelope 1A)是表皮分化复合体(epidermal differentiation complex, EDC)中的一员,位于染色体1q21.3。该基因编码的蛋白质参与角质形成细胞终末分化,是构成角质包膜(cornified envelope)的重要组分,对皮肤屏障功能的维持至关重要。LCE1A在表皮分化过程中表达上调,其表达异常与多种皮肤病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
寻常型银屑病 LCE1A基因变异可能影响表皮分化,导致皮肤屏障功能受损,参与银屑病发病。 GWAS研究显示LCE1A区域与银屑病显著关联(PMID: 19169254)
特应性皮炎 LCE1A表达下调可能削弱皮肤屏障,增加过敏原渗透风险。 表达谱研究显示特应性皮炎皮损中LCE1A表达降低(PMID: 22158542)
皮肤鳞状细胞癌 LCE1A表达异常可能影响角质形成细胞分化,与肿瘤发生相关。 初步研究提示LCE1A在皮肤鳞癌中表达下调(PMID: 23570665)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达(基于GTEx和HPA数据)
食管 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测到
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
角质形成细胞 暂无可靠数据 分化过程中表达上调
HaCaT细胞 暂无可靠数据 低表达,可诱导分化后上调
其他细胞系 暂无可靠数据 暂无明确证据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs4845456 SNP 人群频率约0.3 位于启动子区域,可能影响转录因子结合,与银屑病风险相关(PMID: 19169254)
rs6701792 SNP 人群频率约0.2 位于基因间区域,可能影响增强子活性,与银屑病相关(PMID: 19169254)
拷贝数变异 CNV 罕见 LCE1A拷贝数缺失可能影响蛋白表达,与皮肤屏障缺陷相关(PMID: 22158542)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LCE1A功能缺失突变可能导致角质包膜结构异常,削弱皮肤屏障,增加皮肤病易感性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明LCE1A存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

LCE1A为单倍体不足基因,显性负性突变证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0001533 cornified envelope • GO:0005198 structural molecule activity
• GO:0008544 epidermis development • GO:0005576 extracellular region
• GO:0005737 cytoplasm

相关通路

Keratinization (R-HSA-6805567)
Formation of the cornified envelope (R-HSA-6809371)

蛋白质功能简介

LCE1A蛋白是角质包膜的组成部分,富含谷氨酰胺和赖氨酸,通过转谷氨酰胺酶交联形成不溶性结构,提供皮肤机械强度和屏障功能。该蛋白在表皮终末分化过程中表达,其表达受AP1和AP2等转录因子调控。

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