LCE1D基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱

LCE1D是表皮分化复合体中的晚期角质化包膜蛋白,参与皮肤屏障形成,与银屑病等皮肤病相关。

基因信息卡

基因符号 LCE1D
基因全名 Late Cornified Envelope 1D
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q21.3
NCBI Gene ID 353135 ncbi.nlm.nih.gov/gene/353135
Ensembl ID ENSG00000187572
UniProt ID Q5T7P2
OMIM ID 612605
HGNC ID 29449
基因别名 LEP6, LELP1

基因功能与研究简介

LCE1D(Late Cornified Envelope 1D)是位于染色体1q21.3的表皮分化复合体(Epidermal Differentiation Complex, EDC)成员,编码晚期角质化包膜蛋白。该蛋白在表皮终末分化过程中表达,参与角质细胞包膜的形成,对皮肤屏障功能的维持至关重要。LCE1D的表达受钙离子和分化信号调控,其异常表达与银屑病等皮肤疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
银屑病 LCE1D基因拷贝数变异和表达下调可能削弱皮肤屏障,参与银屑病易感性。 较强研究证据
特应性皮炎 LCE1D表达改变可能影响皮肤屏障完整性,与特应性皮炎相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达(基于GTEx和FANTOM5)
食管 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测到
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
角质形成细胞 暂无可靠数据 分化诱导后表达上调
HaCaT细胞 暂无可靠数据 钙离子处理可诱导表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
拷贝数变异(CNV) CNV 人群中常见 可能影响基因表达剂量,与银屑病风险相关
rs4845456 SNP 频率未知 可能影响转录调控,与银屑病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LCE1D功能缺失突变可能导致角质化包膜结构异常,削弱皮肤屏障,增加皮肤病易感性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明LCE1D存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明LCE1D存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0001533 (cornified envelope) • GO:0005576 (extracellular region)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0031424 (keratinization)
• GO:0045095 (keratin filament)

相关通路

Keratinization (R-HSA-6805567)
Formation of the cornified envelope (R-HSA-6809371)

蛋白质功能简介

LCE1D蛋白是角质化包膜的结构成分,富含谷氨酰胺和赖氨酸,通过转谷氨酰胺酶交联形成不溶性屏障。该蛋白在表皮分化后期表达,参与皮肤屏障的形成和维护。

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