LCE3D基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LCE3D是表皮分化复合体中的晚期角质化包膜蛋白,参与皮肤屏障形成,与银屑病等皮肤疾病相关。

基因信息卡

基因符号 LCE3D
基因全名 Late Cornified Envelope 3D
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q21.3
NCBI Gene ID 84648 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84648
Ensembl ID ENSG00000187532
UniProt ID Q5T5A8
OMIM ID 612605
HGNC ID 16614
基因别名 LEP3, SPRL3A

基因功能与研究简介

LCE3D(Late Cornified Envelope 3D)是位于染色体1q21.3的表皮分化复合体(Epidermal Differentiation Complex, EDC)中的一员,编码晚期角质化包膜蛋白。该蛋白在表皮角质形成细胞终末分化过程中表达,参与角质化包膜的形成,对皮肤屏障功能的维持至关重要。LCE3D基因的缺失或表达异常与银屑病等皮肤疾病的易感性相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
银屑病 LCE3D基因缺失(LCE3C_LCE3B-del)与银屑病易感性相关,可能通过影响皮肤屏障功能及免疫反应参与疾病发生。 较强研究证据
皮肤屏障功能障碍 LCE3D表达下调可能削弱角质化包膜完整性,导致皮肤屏障受损,增加外界刺激物渗透。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx和FANTOM5,但nTPM值未提供)
食管 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测到
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
角质形成细胞 暂无可靠数据 分化过程中表达上调
HaCaT细胞 暂无可靠数据 表达可检测
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
LCE3C_LCE3B-del 拷贝数变异(缺失) 人群频率约30-40% 功能丧失(Loss of Function),导致LCE3D基因缺失,可能增加银屑病风险
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LCE3C_LCE3B-del导致LCE3D基因缺失,属于功能丧失型突变,可能削弱皮肤屏障功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0001533 cornified envelope • GO:0005576 extracellular region
• GO:0005615 extracellular space • GO:0005198 structural molecule activity

相关通路

Keratinization (R-HSA-6805567)
Formation of the cornified envelope (R-HSA-6809371)

蛋白质功能简介

LCE3D蛋白是角质化包膜的组成部分,富含谷氨酰胺和赖氨酸,通过转谷氨酰胺酶交联形成不溶性结构,提供皮肤屏障的机械强度。该蛋白在表皮分化过程中表达,并可能参与皮肤屏障的修复和免疫调节。

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