LEFTY1基因|基因功能、疾病关联、突变与信号通路研究
LEFTY1是TGF-β信号通路的关键配体,参与胚胎左右轴建立,其异常与多种发育疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LEFTY1 |
|---|---|
| 基因全名 | left-right determination factor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q42.12 |
| NCBI Gene ID | 10637 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10637 |
| Ensembl ID | ENSG00000143799 |
| UniProt ID | O75610 |
| OMIM ID | 603037 |
| HGNC ID | 6555 |
| 基因别名 | LEFTY-A, LEFTYA, EBAF, LEFTY1 |
基因功能与研究简介
LEFTY1(left-right determination factor 1)是TGF-β超家族中的一种分泌性配体,在胚胎发育中参与左右轴建立,通过抑制Nodal信号通路发挥作用。LEFTY1在多种组织中表达,其异常表达与多种疾病相关,包括先天性心脏病、内脏异位和某些癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 左心室流出道梗阻 | LEFTY1突变可能影响左右轴建立,导致心脏发育异常。 | ClinVar |
| 内脏异位 | LEFTY1突变与内脏异位相关,影响左右不对称性。 | OMIM |
| 先天性心脏病 | LEFTY1表达异常与先天性心脏病相关。 | PubMed |
| 子宫内膜异位症 | LEFTY1在子宫内膜中表达,可能参与子宫内膜异位症的发生。 | PubMed |
| 癌症 | LEFTY1在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促进因子。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短 |
| c.1000delC (p.Leu334TrpfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变:导致LEFTY1蛋白功能丧失或减弱,可能影响Nodal信号通路的抑制,导致左右轴发育异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变:目前暂无明确证据表明LEFTY1存在功能获得突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:可能通过干扰正常LEFTY1蛋白的功能,影响信号通路,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005125 (cytokine activity) | • GO:0008083 (growth factor activity) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0005576 (extracellular region) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) | • GO:0001944 (vasculature development) |
| • GO:0007368 (determination of left/right symmetry) | • GO:0009887 (animal organ morphogenesis) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells (hsa04550)
蛋白质功能简介
LEFTY1蛋白是TGF-β超家族的一员,作为Nodal信号的拮抗剂,在胚胎发育中调节左右不对称性。该蛋白包含一个TGF-β样结构域,通过结合Nodal受体复合物抑制信号传导。LEFTY1在多种组织中表达,其功能异常与发育缺陷和癌症相关。