LEMD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LEMD3编码内核膜蛋白,调控TGF-β信号通路,其功能缺失与骨发育异常及肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 LEMD3
基因全名 LEM domain containing 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q14.3
NCBI Gene ID 23592 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23592
Ensembl ID ENSG00000174106
UniProt ID Q9Y2U8
OMIM ID 607844
HGNC ID 28887
基因别名 MAN1, LEMD3, OTTHUMP00000020412

基因功能与研究简介

LEMD3基因编码LEM结构域蛋白3(LEMD3),又称MAN1,是内核膜蛋白,参与调控TGF-β/骨形态发生蛋白(BMP)信号通路。LEMD3通过与R-SMAD蛋白相互作用,抑制TGF-β和BMP信号传导,从而影响细胞增殖、分化和凋亡。该基因的突变与骨发育异常(如骨硬化症)和肿瘤发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
骨硬化症(Osteopoikilosis) LEMD3功能缺失导致TGF-β/BMP信号过度激活,影响骨形成,已明确致病。 已明确致病
Buschke-Ollendorff综合征 LEMD3功能缺失导致皮肤弹性纤维瘤和骨硬化症,已明确致病。 已明确致病
肝细胞癌 LEMD3表达下调或突变可能促进肿瘤进展,具有较强研究证据。 具有较强研究证据
胰腺癌 LEMD3突变可能影响TGF-β信号通路,与肿瘤发生相关,具有较强研究证据。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胰腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HepG2 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2074C>T (p.Arg692*) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1963C>T (p.Arg655*) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1601G>A (p.Trp534*) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致LEMD3蛋白截短或降解,丧失对TGF-β/BMP信号的抑制作用。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005635 (nuclear envelope) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) • GO:0030509 (BMP signaling pathway)

相关通路

TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
BMP signaling pathway (hsa04350)

蛋白质功能简介

LEMD3蛋白(MAN1)是内核膜蛋白,包含LEM结构域和MAN1-Src1p-C-terminal (MSC)结构域。它通过与R-SMAD蛋白(如SMAD1、SMAD2、SMAD3)直接相互作用,阻止其磷酸化及核内积累,从而负调控TGF-β和BMP信号通路。该蛋白在细胞核膜上发挥支架作用,参与基因表达调控和细胞周期控制。

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