LEMD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LEMD3编码内核膜蛋白,调控TGF-β信号通路,其功能缺失与骨发育异常及肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LEMD3 |
|---|---|
| 基因全名 | LEM domain containing 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q14.3 |
| NCBI Gene ID | 23592 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23592 |
| Ensembl ID | ENSG00000174106 |
| UniProt ID | Q9Y2U8 |
| OMIM ID | 607844 |
| HGNC ID | 28887 |
| 基因别名 | MAN1, LEMD3, OTTHUMP00000020412 |
基因功能与研究简介
LEMD3基因编码LEM结构域蛋白3(LEMD3),又称MAN1,是内核膜蛋白,参与调控TGF-β/骨形态发生蛋白(BMP)信号通路。LEMD3通过与R-SMAD蛋白相互作用,抑制TGF-β和BMP信号传导,从而影响细胞增殖、分化和凋亡。该基因的突变与骨发育异常(如骨硬化症)和肿瘤发生相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨硬化症(Osteopoikilosis) | LEMD3功能缺失导致TGF-β/BMP信号过度激活,影响骨形成,已明确致病。 | 已明确致病 |
| Buschke-Ollendorff综合征 | LEMD3功能缺失导致皮肤弹性纤维瘤和骨硬化症,已明确致病。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | LEMD3表达下调或突变可能促进肿瘤进展,具有较强研究证据。 | 具有较强研究证据 |
| 胰腺癌 | LEMD3突变可能影响TGF-β信号通路,与肿瘤发生相关,具有较强研究证据。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2074C>T (p.Arg692*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1963C>T (p.Arg655*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1601G>A (p.Trp534*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致LEMD3蛋白截短或降解,丧失对TGF-β/BMP信号的抑制作用。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005635 (nuclear envelope) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) | • GO:0030509 (BMP signaling pathway) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• BMP signaling pathway (hsa04350)
蛋白质功能简介
LEMD3蛋白(MAN1)是内核膜蛋白,包含LEM结构域和MAN1-Src1p-C-terminal (MSC)结构域。它通过与R-SMAD蛋白(如SMAD1、SMAD2、SMAD3)直接相互作用,阻止其磷酸化及核内积累,从而负调控TGF-β和BMP信号通路。该蛋白在细胞核膜上发挥支架作用,参与基因表达调控和细胞周期控制。