LIAT1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LIAT1(Ligand of ATE1)是精氨酸转移酶ATE1的配体,参与蛋白质精氨酸化修饰的调控,与细胞应激反应和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LIAT1 |
|---|---|
| 基因全名 | Ligand of ATE1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 暂无可靠数据 |
| NCBI Gene ID | 100506658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 |
| Ensembl ID | ENSG00000283041 |
| UniProt ID | A0A1B0GTV6 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:53815 |
| 基因别名 | C11orf49 |
基因功能与研究简介
LIAT1(Ligand of ATE1)基因编码一个与精氨酸转移酶ATE1相互作用的蛋白质。ATE1介导蛋白质的精氨酸化,这是一种翻译后修饰,参与调控蛋白质降解、细胞应激反应等过程。LIAT1作为ATE1的配体,可能调节ATE1的活性或底物特异性,从而影响精氨酸化修饰的水平和功能。研究表明,LIAT1在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤的发生和发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | LIAT1在多种肿瘤中表达上调,可能通过调节精氨酸化影响肿瘤细胞增殖、凋亡和转移。 | 较强研究证据 |
| 暂无明确疾病关联 | 目前尚无LIAT1直接致病的单基因疾病报道。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质功能,但证据不足 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致LIAT1蛋白功能丧失或减弱,可能影响ATE1的调控,但具体后果尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强LIAT1的活性或表达,可能促进肿瘤发生,但证据有限。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰正常LIAT1功能,可能影响ATE1信号通路,但尚无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) |
相关通路
• 精氨酸化通路 (Arginylation pathway)
蛋白质功能简介
LIAT1蛋白是精氨酸转移酶ATE1的配体,可能通过直接相互作用调节ATE1的活性或底物识别。精氨酸化是一种重要的翻译后修饰,参与蛋白质降解、细胞应激反应等过程。LIAT1在多种肿瘤中表达上调,提示其可能通过影响精氨酸化参与肿瘤发生。然而,其具体分子机制和生理功能仍需进一步研究。